EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-06070 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:26812605-26813967 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EOMESMA0800.1chr12:26813828-26813841GTTTTCACACCTC-6.78
FOXC2MA0846.1chr12:26813573-26813585TATGTTTACTTT-6.11
Foxq1MA0040.1chr12:26813034-26813045TATTGTTTATA+6.32
KLF13MA0657.1chr12:26813858-26813876GAAAAGTGGGCGTGTCCA-6.67
KLF14MA0740.1chr12:26813861-26813875AAGTGGGCGTGTCC-7.06
MITFMA0620.2chr12:26813251-26813269TAGGGTCACATGACCCAG+6.07
MITFMA0620.2chr12:26813251-26813269TAGGGTCACATGACCCAG-6.07
SP4MA0685.1chr12:26813860-26813877AAAGTGGGCGTGTCCAG-6.7
SP8MA0747.1chr12:26813862-26813874AGTGGGCGTGTC-6.37
TBR1MA0802.1chr12:26813830-26813840TTTCACACCT-6.02
TBX2MA0688.1chr12:26813830-26813841TTTCACACCTC-6.14
ZNF263MA0528.1chr12:26812909-26812930GGAGGAGGAGTGGAGGAGAGC+6.34
ZSCAN4MA1155.1chr12:26813176-26813191GTGTCAGTGTGTGTA-6.52
Enhancer Sequence
CAGTGGCATT GTAAATATGG CCACTGACTG AACTTACTTT CTTTAAAATG GATGTCTTGA 60
TCTGATTGAA ATTAGTCCTT GGCAGGAAAG TTTGGGAACC GATGAGCTAG AACAAGTTTT 120
CGTCGGTGTG TCTCTGTTAA ACAAGTGAAA TAAACAACAC CCATGCTGGA CTCAGGCGTG 180
TGGTTGTGGT CTGTAGGGTT AATGCTGGCC GGCTGTGGTG CAATGCTCTC AGGGTTTTAG 240
GGGAGAGATG CAGTGGTTCG GCGTGTACCT GTCACTACTA AATGATTGCT CATTTCCTGC 300
CACGGGAGGA GGAGTGGAGG AGAGCAGTAA TAGCACACAG CTGCCCGAGC TGGACACTAC 360
CTTTCCTCTT CTACTCTCCT GGTATTCATC TCTCTTGTAT CTTCCTCTCT TCCTATCCCA 420
GTCTGCGTGT ATTGTTTATA TGCAAATCTC TGTCTGGAAT GGCAGAGGTG GACATACACA 480
CCCAAGGTGG CTCACATGTT CTCCACCTAG CTTCTCTGGC TAGGTTTTTG CGTGTCTGTG 540
TGGGTTTGTG TTTGTGCGTA CACACATGCT TGTGTCAGTG TGTGTATGTT TGGGGGAGGA 600
TTGGTTTAAG GAGGGGTCAG TAACAAATTC CATCCCGGTT CCAAACTAGG GTCACATGAC 660
CCAGAATGGA AGTTTAGCAA TGACCAGCTG TAGTCCACAT TACACAGCAG GAGAGAATCT 720
AGCACAATCA CTTAGCTGTA AACGGCATAG GATATGCTTG CTGAGCAAAT TACGAATTAG 780
CCAAAGTCAT CTGGTTATTT CAGAGGATGC TCTATTTAAT ACTGCAATAG ATGGGGTGTG 840
GATATAGATT GTATATGCCA GGGCTGAACA GTAATTATAT GGTTGGTTTT TGTGAGAGAG 900
GCTCAGGGCA GTTGGCAGAA CTGCAGTAGT GCTGTTTTTA CTCCATCAGT TCACTGTTGA 960
AGTGCCTGTA TGTTTACTTT TAATACTTTA TGTTTTTAAT ACTGATACAA TGGGACTTTT 1020
TTTATTGGTA AGTGTTCTAA TGAATGACAT TAAAACAATA TATATTTGTT TAAAAAAAAG 1080
AACAAAAAAT ACTTTGACCT GATATACTGC AGGCAAAGCC AAAAAATTGA AGTAACTTAA 1140
ACAAAATGAG ACTATAATGA AGTTCGTACA CTGTAAAACC CAAAAAGTTA AAGGGCCATG 1200
AAACCCCCTT GTTTCAGCAG GGTGTTTTCA CACCTCTACT TTGGAAAAAG TCAGAAAAGT 1260
GGGCGTGTCC AGCTCTGTTT AGGGGGGAGT GTCGGAGGAA CAAAAGAGGC TTGGTGTGGG 1320
AGTGTCTATT TGGGCATGCT GAATTTCAGA GTCAAAACAC AC 1362