EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05949 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:24309239-24310911 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr12:24309331-24309345TTTGTTTATGTTTA-6.3
IRF1MA0050.2chr12:24309945-24309966TCTCTCTCTCACTTTCACTTT+6.64
IRF1MA0050.2chr12:24309951-24309972TCTCACTTTCACTTTTGCTAA+6.75
PBX1MA0070.1chr12:24310796-24310808TATGATTGATGT-6.11
POU2F2MA0507.1chr12:24310474-24310487CGCATTTGCATAA+6
PRDM1MA0508.2chr12:24309953-24309963TCACTTTCAC+6.02
Pou2f3MA0627.1chr12:24310473-24310489TCGCATTTGCATAAGA-6.94
TFAP4MA0691.1chr12:24309547-24309557ATCAGCTGTT-6.02
ZNF263MA0528.1chr12:24309910-24309931ACCCTCTCTCCTTCCTCCATC-6.14
ZNF263MA0528.1chr12:24309907-24309928CTCACCCTCTCTCCTTCCTCC-6.43
ZNF384MA1125.1chr12:24310336-24310348TTTAAAAAAAAA+7.22
ZSCAN4MA1155.1chr12:24310723-24310738TTGTCAGTGAGTGCA-6.05
Enhancer Sequence
GAGTTTTCAA CACCTTTTTG TACAAAAAGA CACAGTTCCA GTTCATGTTG ATTGTCCTGT 60
CTCTACAGAT TTGGTTAGTG TGATCAATGT TCTTTGTTTA TGTTTATTCA AATGGCAAAG 120
TTAATATCAT CAGCAGTACT AGTTTTTAAG GACAAACCTT AATCAAAATA ATTTAGTTAC 180
TAAGTTTACA GTAATATCAG TACAATATTA TGGACTGAAA ACTCTCCACT TCTAAACAGC 240
TCTCAAATGC TGCTCTCCAA ATCACTTTCC ATCTCCTCTG CATCTGTGTT TATGTTGCTG 300
GTGTGAAAAT CAGCTGTTGT GCATGTAACA AAGCTCCACT TTTCATGCAA ACCCTTCCTT 360
TTTTCGCCAC TCGCCGCTTT AACATGGACT TTTACCCACT GTCCTGACTT TTCTTTTTTT 420
AAGTGGACGT GTGAAACAGC CTGCTGAGAC AGGGGGGTTT TCGCGGTCCT TTAAAAAATC 480
CCAAATAATA ATGAGAATTT TTATATTTTT TTTGTTTAAA CTGCCCCTGT AACCTCTATT 540
TTTCACTATA CTTGATCTTT GCAGTTTCTC CATTTTAGCT TGTTTCTGTT TTTGCTCTGA 600
TGCTCTTTTT TTCTGCTGAT CTCTATCTCC CCACCTCTGT TTTTTTCGAT GTATGTTTAT 660
ATCCGAATCT CACCCTCTCT CCTTCCTCCA TCTCTCTCTC TCTCTCTCTC TCTCTCACTT 720
TCACTTTTGC TAATGGGGTG CTCTGAGGTC TTGTGTGCAA GGAATTGGCA GAACACTGGG 780
ACATATGGCA GGGACTGAGT GAGAGGGTTG GCTGCTGGTT TGATGCTCCA GAGAGGTAGC 840
TGGCTCTGAC AGGTCGGACA GGTCCCAACG CATGGAGGAG GACTTTCCAA AATAAAAGTG 900
CCCGCCTGGG TTTCTCGAGA AGAGCTGTGA AATAAATATG CGTTAGTGGA AGAATCTGTT 960
TTCTCTCATC TCCTTGGCTG GTTTCCAGAT GAACCGAATC TTCTCCTGTA TGAAACTGAG 1020
ATAAGATCTT AAGATTTTGA CGTCACTCAA CCACAGGCTT CTTCGATTTT AATGTGCTGT 1080
CCTAGAAAAT GGTAGTGTTT AAAAAAAAAC GCTGAGGCTC CACACCTGGG GAAGTGAGAG 1140
AGAGCAGTTC AAAAGTTGAG ACGTATTCGT TAGGAGAGGC AGAGATGCCT GTAGGACGGC 1200
AGGCTGCGTG TCTGTGTGAC GCCAGTTTGT CTCCTCGCAT TTGCATAAGA AAGGCAGTAA 1260
TGAGGTGCTG TGGAGGTGGA TAGAGCGTTT TGAAGTGAGT TGTGACTTCG CGCTGCATGT 1320
TCCACAGATT CACGGCTATT TTTTGAGAGA TATGTGTTTG GATCGTTTAA CTAAAGGTGT 1380
CTGGTCACAG CTGAATATAG GAAGGCATTT AATAGTGCCA TTTTTCAGAA TAATAATCAG 1440
ACTCTTTGTT CACAAACACT GCAGCTAGGA AACTTGGATT TTATTTGTCA GTGAGTGCAT 1500
TTTCAACCCT GTAAAAAGCA CAGATTTTTT GCTTTTTAAA AATGCTTTTT ATGAAAATAT 1560
GATTGATGTG TTGATGTTGA TAGAAGATCG ATTTGCAAAA TATACTTTTT GTTTAATGAG 1620
GAAGATTCAT ACTTTTGCAT CCTCTGAGAT TGTAAGAATG TTGGTCGCTG TA 1672