EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05574 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:9095253-9095817 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx1MA0854.1chr12:9095318-9095335GGATTTAATTAATTATT+6.18
LMX1BMA0703.2chr12:9095319-9095330GATTTAATTAA+6.02
Lhx3MA0135.1chr12:9095323-9095336TAATTAATTATTT+6.71
Lhx3MA0135.1chr12:9095320-9095333ATTTAATTAATTA-6
Enhancer Sequence
CTTTATTAGT GATTTGTTGG ACGGGTGTTC ATTTTCGTGT TAAATTACAG TCTTTTAAAC 60
TTATTGGATT TAATTAATTA TTTGTTTGGC GTTTTAAACA CTAAATGATA TTTAAATGGA 120
GCTCAATGAA GAAATGGGTG ATGTGGGCCT CCCTCTGGTT GGCTCATCGC ACCGCTACCC 180
TTTTGTGGGA CAGTCACAGA CCGCAACACA TCCCGTAACG GCAATGACTC ATAATATTAC 240
AGGAAACACT TATCATGCAT TATTTCTTAT GGTTAACACT TAGTTGTAGC TTTTAACCAG 300
AAAACTTTTA TTTTATCTTT AATTTTTTCA AAACCTTCAA ACGGATGTAT CGTTTATTTA 360
TGTTTTATTA TTAACATAGC CTATAAAAAA GAGCATCAAA CAGTCTTTAT TTGACATCCA 420
TTTGCATTGC TCAGTACATT CTTAAAAATA AAGGATCCAG AAGATGCCAC TGAAGAGTCA 480
CCTATACGTT AACTCAGTGC ATTAACTAAT GTTAAGCACA ACATTGGAGT TTAATATTCA 540
TTAATTTTCC TTTGCTTAAT CCCT 564