EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05561 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:8924213-8926519 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr12:8925512-8925523AATTTAATTAA+6.32
POU3F1MA0786.1chr12:8925516-8925528TAATTAACATAA-6.04
POU3F2MA0787.1chr12:8925516-8925528TAATTAACATAA-6.07
PRDM1MA0508.2chr12:8925764-8925774TCACTTTCAC+6.02
RARA(var.2)MA0730.1chr12:8926000-8926017AGTTCACTAAAGGGTCA+6.32
Enhancer Sequence
CACCGAGTTT TTATAACTAA AACCGAGTTT ACCACACGCA TTGATTCGCT TTCAGCTATT 60
AATATCTTGT TTAGGCTACA TGTTTGTTTA TCGATCCATC AATATTAGTA ATCTTCTTTC 120
TAAGAAACGC TGTATTTCTG GTCTAATTTT TCATTCTCTC CCAGCGCGGA GTTTTGTGTG 180
CTGGTGCCGG TGCTCGTTCC CGGGCGCTGG TGACCCGCTG GTGACCCTGC AGCGCGGACC 240
CTGACATCTC TGTGAACTCC GAGAGCAAAG CTCGCCAAGT TCACTGTCCA TCAAATAACG 300
AGATACGCCG CCTGAGCAGC AGTAATTATC CACACTGCCA TCTATTCTGC GTTGTCCATC 360
ACAAAAATCA AATCAAGGGC ATCATTAAAG CCACTTACAG TAATGTTCTA ATTGGGTCAA 420
GAGATAAACA ATCTTTCACT GCAGCGCGAG AGAGAAGGAG AGAGAGATTT AATTGGAGCC 480
TTCGATGAAG ATCGACGCTT TTATCAGTTT TCCCCGCCTA TATTTAGCCA TGCAAGAGGG 540
GAAAACCTGT TTTCAAAACG TAGGCCTAGT TGGAAATTAT ATAATGACTT TTAAGGAATA 600
GTTTACCCAA AATTAAAATA ATGTAGTCAT TCACCCTGTT TACTCATTAC TTAAGCCTAC 660
TTTCTTGTTG AACGCAAAAG AAGACATTTT GAAGAAAGCT TGAAACCTGT AGCATTTACT 720
TCCATAGTAT TTGTTTTTCC TTTGGAATTG CAGGTTGTCA GCTTTCTTCA AAACATCTTC 780
TTTTGTGTAC ATCAAAACAG AAACTCCTAA AGGTTTGGCA CCACACGAAG GTAAGAAGGC 840
TAAATATTAA GTAGCCCCCT AATTTCTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC 900
TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTGGG TTTCTTTCTT TCTTTCTTTC TTTCTTTCTT 960
TCTTTCTGTC TGTCTGTCTG TCTGTCTGTC TGTCTGTCTA TCTATCTATC AAAAATGTCA 1020
CAGGAATTGT GAGAGCTAAA GTTTGTTGTG ATGATAGCGC GGTTAAACTC CGATAATTTC 1080
AAAATAGCCT GTTTTAAAGA AAGTAAGTTT ATTATAGAAA ATATAGGCTA TGCAAAATAA 1140
TATATAAACA AAACTACAAA CCTACCGTGG GCTCACATAA GACATAAAAG AAGTGTTATT 1200
TTTGCCTCCT CAGGCGAACA CGACTTGCAC TCCAAACAAT GCAGGATTGT TCCGACGCAA 1260
ATTTGGGTGA AATGTGGACA AACCTAAGTT TGGGTTCAAA ATTTAATTAA CATAACTGTT 1320
GGGGTTGTCC ATATTTTACT CAGATTTAGC TCAGTCCTTT ATTTAGTGCG CAATGACATG 1380
TAATTTCTAA CTTTGGTGGT GACTAAAATG CAAAAAAATA GTCAAGAGTC TTTATTTAGC 1440
AGCACACCCC TTCCCCACAT AATTCGCACC CCCATAAAAA GAAACATTTT GATTACAATC 1500
TTTGAAAATA TCTCTACCCT CTGAGGAAAG GAAATATATA CCCTATTATC ATCACTTTCA 1560
CAGCATATAA CTATATAATC TTTACCTTAG ATGGCGTGTC TCTGCAGCCC GCTGGAGCTA 1620
CTGGCTGTTG TTGTTTACTT GCATAAAATG ACTCGCATTA GTGACACGTG GCACAGCTAT 1680
AGGTAGTGAA TTTGTCTTTG ATTTATGAGT TTACATGACA TATAGACCCG CGAACGCAGT 1740
TTGAACCGTG AGCACCGCAG GAGGGGGTCA CGAGAGCACA GCCAAACAGT TCACTAAAGG 1800
GTCAGACTGA AGACTCGGAT TTGAAGCCGT GTAACCTGCA GTCTCTGGAG CCTCATTCCG 1860
CCTTTTATTT GCATTTAAAA ATACTGTTGC TATTAAAGGC TCCGACTTTC CTGGCCAAAG 1920
CAAACTAAAC GATCAGATAG TGGAATATAA ACGGGTTTAA CCGTGTCAGC GTAGGTTGTA 1980
TAATTAATGC CTTTTGAAGA TAGCTTATGT GTAAATGAGT GTTTCTATAG GGTTTTGTTA 2040
TTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTGTGTGT GTGTTTGTTT TAGAAATACA 2100
AAATATTAAG CACTTAAACT TAATTACTTA ACTAAATGTA TTGGCTGAGC TTACTAGTGT 2160
TTGTCATGGT GTAAACTTGT AGTTCATTTA GATTTTATTC AGTACTATTA TTCTACAATG 2220
TAATTCTGTG CATATGCATC TCTTTTTAAA TCAGTTTATA ACACAAATAA GGACTGGATT 2280
TAACTAATAA CTGAGGCAAG CAGCCG 2306