EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05410 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:4562571-4563655 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BACH2(var.2)MA1470.1chr12:4562632-4562652ATAGCATGAAGTCACGATTC+6.26
CTCFMA0139.1chr12:4563251-4563270TGACCACAAGATGGCGGAG+6.63
FOXD2MA0847.2chr12:4563338-4563351TTGTTTATTTAGC-6.12
FOXE1MA1487.1chr12:4563337-4563352GTTGTTTATTTAGCA-6.94
IRF3MA1418.1chr12:4563190-4563211CAGTTTCGATTTCCCCTTTTC-6.46
NKX2-5MA0063.2chr12:4563591-4563601ACCACTTGAG+6.02
SOX21MA0866.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT-7.61
SOX21MA0866.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT+7.85
Sox11MA0869.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT-6.45
Sox11MA0869.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT+6.9
Sox1MA0870.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT+7.58
Sox1MA0870.1chr12:4562937-4562952AACAATGTCATTGTT-7.95
YY1MA0095.2chr12:4563257-4563269CAAGATGGCGGA+6.27
Enhancer Sequence
ATCCTAAATG ACACTTTAGT ATTAAAAATG TACATGTCTA GATAGACAGA AGGCATTACC 60
AATAGCATGA AGTCACGATT CATATAATGA TGCAATCACA TACACTCACT GTGATGCAAC 120
ATTACAACTA CAAACCAAGT TGAAATATCC ACGTATGCAT ATACAAACTC TCACAACTGC 180
CACACATATC CTAAAATGCA GTAAAATATA AATCCGGAAT TACTATTTAT TATTATTTCA 240
TCGTCTAGTT GGCTTGACAG TAACGTTAAC GTTAGCCTAT AAACATTTTA TGACAAATCG 300
CAGAGGCCAT TTTAACTTCA AAAAGTGCAT GCATATATTA TTGAATAATA TGTATGTAAT 360
AAATAAAACA ATGTCATTGT TCATATAATA ACCCATTAAT ACGCTACAAT AACAAAAGTC 420
CCGTGGCTGT CAATGGTAAC TTACCTTGCA AACAGAAGCG ACAGTTGTTT GTGGCCTCGT 480
GTGTTTTCAG CGAGCTCTTC CTCAGATGTA AGAGATGTAA GTAGACAGAA CTGCTTGTCA 540
ATGTTGTTTT AATACTGAGC TTTATTCAGC AGACTGTGCT TTACGATCAG GTTTTAAACA 600
TTACTCGGGA AACCCATATC AGTTTCGATT TCCCCTTTTC GCGTCATTAC ACACGTCACC 660
GTAAGTTATT TTACCCTGCA TGACCACAAG ATGGCGGAGA CGACCATTAA AAAAGAACGT 720
AAACAACAGA CGATTAAAAT GTGTTTTCGT GTGTGTCAGG CCTGTCGTTG TTTATTTAGC 780
ACTTTAAAAT AAGATTTATT TGTTTATTGG CTACATTAAA AAATAACAAT GAACAATACA 840
GTTCACCCAA AAATGAAAAC TGTCATTAGT TAGCCTACTT CCCTTTACTT GTATTTCTTC 900
ACAAGTCTTT CTTCTGTTGA ACACAAAAGA AGGTATTTTG AAGAATGCTG AAAACCGGTA 960
ACCATTGACT TTCCTCAAGT TAATGGTTAG CGGTTTTCAA AACTCAAAAA CATGTTTGGA 1020
ACCACTTGAG GAAGAGTACA AAGAGAGTAA ATGTTGATTA TTGGGTGAAC CAAATTCTTT 1080
AATG 1084