EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05382 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:3274879-3276021 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr12:3275720-3275732GAATGTTTTTTT+6.52
HSF2MA0770.1chr12:3275715-3275728TTCTAGAATGTTT+6.23
PBX3MA1114.1chr12:3275255-3275272ACCTGACTGACAGGCAG+6.34
Enhancer Sequence
ACACACACAC ACTCAAAAAC ACTAACATCT AAGTCATCAA GTATAAATCA AAAATGTCAT 60
TTAACATCTG CTGTATTAAA AAATGAGTAC AAAACCAAAC AAAGCAGGTA GAAAAAGCTG 120
TTTAAGACAT CAATTGCAGG CTACTGCTTA TTATAATGCA TAAAAATGTC ATTGAGTAGG 180
AAGCTGACTG GATTTTAAAT CAAAATTGTG TGTTTTAGGA CAAATTCTCC TCACCTTTTC 240
CTCTAAACTC ATTTTTTTTC CCAGTAAGTG AAGCATTAGG TTAATCCGAC ATGTCTGTGT 300
GATATGGCAA CAATGATAGA TAACACTAAG CCAGATTTAA ATACACATTC AAAGGGCCTT 360
GTTTTGGACA GGTCGGACCT GACTGACAGG CAGCGCAGAC TTCATCACAC AGGTATGAGA 420
AAAGTCAGAT GCTGGAAAAC AAATCCTGTC TGAAGCTTGA TAATTGCTTT TAAACTTCTG 480
GGATTTGACA GTTAAAAGCT AGAAGTCTTT AACAATACTG TTAGCTGGAT AAACACTGCT 540
AACATGTTTA GAATCTGGCT AATATGCTAT TAGCACGATT CTGAACCCAG TCGGTATCCT 600
ACAGATTGTT AGTATCGACA AACTACTGTT TCAGCACGAT GCAAACACAT TAGTAGCATG 660
TTTGACTGTG TTTCTAGCAA GTTTCTAGCA TGACCTACCA TGTTGGTCTG GGTTAGTTGT 720
TATACTTTGC TAGTCAGAAG ACAGTTTACA CAATCTTAGC ACATTGTTGG CATGTTTAAA 780
CACAATACTA GACATCCTTC AAAACATCTG ACATTACTAG CATGAAGTTA GCATTCTTCT 840
AGAATGTTTT TTTAAGTTCC TAAAACGATT AACCATGTTA TCCTGGGTTA GTTGTTTGGG 900
TTTGCTTGTC ATAAGACAAC TTATATACTC TTAGTACATT GCTAGCAAAT TTAAGCACAT 960
TACTAGCACA TTTCTACCAT CTTTTGACAC TACTAGCACA AAGTTAGCAT TCTCCCAGCA 1020
TGTTTACCAA ACTCCTAATG TATGATGCTA ACACATTGGT AACATGTTTT AATGTGATGG 1080
TAGCAAGAAT GATTCCCCAT GTTGTCCTGA GTTAGATGTT AAGCTTTGCC AGTCATAAGA 1140
CA 1142