EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05313 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr12:944272-946311 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
PHOX2AMA0713.1chr12:944665-944676TAATTGAATTA-6.14
Phox2bMA0681.1chr12:944665-944676TAATTGAATTA-6.14
RFX1MA0509.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.54
RFX1MA0509.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.55
RFX2MA0600.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.82
RFX2MA0600.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.86
RFX3MA0798.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.48
RFX3MA0798.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.73
RFX4MA0799.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-6.28
RFX4MA0799.1chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+6.69
RFX5MA0510.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA-7.13
RFX5MA0510.2chr12:945339-945355AGTTGCTATGGTAACA+7.14
RORA(var.2)MA0072.1chr12:944583-944597TTGACCTACTTATT-7.82
RORCMA1151.1chr12:944584-944596TGACCTACTTAT-7.22
Enhancer Sequence
TCCCCGCCAC CCTGCGCTCC ATTTCCGGAT TATAATATTA CGACATGGGG GAAAGTATCA 60
TTAGCATCGC TCACTGACAT CTGACAGGAC AAACCGCAGC TGCTTGGGTT TGTTGTTTTC 120
CCTTTTCTGT GTAGCAACCA AATGTGTCCG TGAGTAGACG TTTCGGCAGC ACAACAGTTC 180
CGAGAGTAGC AGTTATGAAC ATTATTTATT AAATTACTCA TTAATTGTAT TTTTTAACGT 240
CTACCCCTTC CCCAACTCTA AATCTACCTC TCACACTAAA TTAAAACGGT CATTATAACG 300
AGGATTTCTA ATTGACCTAC TTATTAATTG TATTGTATAA TCGCGTACCC CTGCCTCAAA 360
ATAAAGTAAA ACAGTAAATA AAAAGAGAAT TATTAATTGA ATTACGGATT AAATTGTATT 420
TTATTAACGC CTACCACAAC CCTAACAATC ACTGAAATGT AAAACAGTAA TGATACTAGG 480
TATTATTCAC ATTATTTATT AAAATTGCTC ATTAAATGAT AATTTATTAA CGTCTACCTC 540
TACACCAACC CTCACAGTAA TGCAAAACAG TAATTATACC GAGTATTATT GATATTATTT 600
ATTAAATTAC CCATTAATTC TATTTTGATA ACATCTACTG TTTACCGAAA CTTCGGGCCG 660
CAGCTGTATC CCTTCTAGAC TTTACCCGGA CACATTTGAG GAGACACTAG CTCCCACTGC 720
TCAGCCGTAA TTTTATTTAT TTATTAATTT TACTGTTCAG AATATACATA TATAATGGCA 780
CTGACGAATA TAATATAGCA AATATTAAGC AAGGCACATA CACAATTGGA CAATGAACCT 840
GTAAATTAAA ATAATTAGAA TATTTCATCA TGTTGGGCAC TAAAACCACC AGACACTCGC 900
TGTAGCTCTG ATAAACGTTT TATTCACTAA AAAACTACGT GCTCTGCGTT TGTCTGAGTT 960
AATAAGTCTA CCTTTATAGC TGAAATGATC AAATATTACA GTTATTTATA GTAAATATGT 1020
AGTGTTTTGG ATAGTAAAGA GCTATAATCA ATCCGTTGTG GTGATTCAGT TGCTATGGTA 1080
ACACATTCAT TACAGTAATA TAAACAAATG ACCCAAAACT GTAGTTTTCT ACAAATGTAA 1140
GGTCTATTTG AACAAATACT ATAGAGCATT GCTGTGTATT ATTCTCCAAA CATCCTTTGT 1200
TTCCCAAGAA AACCCTTATT TGAGTCCCCC TGCAAAAGCC AATTCAAAAC CCCTGATAGC 1260
AAAATAAAGT GATAATTGTG ATCAAATTGT GGTGTATATT AAAAATCAGC TGTATTATCA 1320
AAAACTCCAG TGAAATTAAA TGACTTTTTT CAGATGTTAG TATCAGTATA TTAGATTTAA 1380
GGATGTCTAC AATCTAGTGT GCTCCAAAAA CAGTGACAAA AATCACATTT ATTAAATATA 1440
ACCCTGTTTG AAGTTGATCT CTTCTGTCTA AATCATACCT GCCAACATTT GTCCCTGAAA 1500
ATCCGGGAGA CCGGGGTTGG AAGTGAGGTG TCTGAATAAC ATTGTTGTGA ACCAGGTGTA 1560
CTGTGGTGAT TGTAACTACT ATGAAGCATG TTTCGGGCCG CCGCTGCGAT CAGACCCAAT 1620
ATATACCAAT ACATTGGATC CGATATACCA TTTACCAATG TTGGCAACCC GGGGGTTTCA 1680
CAGACCGTAC CAAATTGCTG AGGACTGCGA GGGGGTGGTT GAAATTACGG AAGTTTTCCG 1740
GGATAAATAA CAAAACGGGA GGGTGGCGGG AGATGGGTTG GAAATACAGG AGACTCCCAG 1800
GTAAAACAGG AGGGTTGCCA GGTATGACCA CAATGGATAT TTTTGACGTC ACCTCATACT 1860
GCAGTTTCTC ATCGAATCTT CTGCCCAATC AAATGCACTC AGGTGTCTGA AATGCCCCAC 1920
CCCTTTCTTC TCATTGGCTT TTTAATTTGA TGTGCTCAAG CTCAACCACT CTCACTGGCA 1980
GAGTGGTGAT AAAACAACAG CTATTGGCTG TTATTTAAAA AGAGGGGAGC TGATATATG 2039