EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05232 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:44278150-44279072 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFKB1MA0105.4chr11:44278425-44278438CGGGGAATCACCT+6.11
PHOX2AMA0713.1chr11:44278592-44278603TAATTTAATTA+6.62
PROP1MA0715.1chr11:44278592-44278603TAATTTAATTA-6.32
PROP1MA0715.1chr11:44278592-44278603TAATTTAATTA+6.62
Phox2bMA0681.1chr11:44278592-44278603TAATTTAATTA+6.62
SOX13MA1120.1chr11:44278718-44278729TTCCATTGTTT-6.32
Enhancer Sequence
TATGAACNNN NNNNNNNGAT CAGTCTGAGA GTGTTTGAGC GTCTGCTGCT CCGTCATTTC 60
CACAATCGTC ATCAATAATG ACGCAGATTT CCACTGATGT AGGTCACACA CATGCAGAGA 120
CACGTGCAGC ATCAATACAC TGCTCTCTGC TGCTCAGACC TGCCGGGAAA TAATCTGCAC 180
GACTGCTGCC GTCTGTTGCT GTGATAACAC TCAGCTCTGG AATACAGATG AGTGTAAGAA 240
GTCGTCTGTC GTGTTTATAC AGAAATAAAG GCTGACGGGG AATCACCTCT GCAGCTGATT 300
GTGTACTTCG AGTGCCTCGT TTGATGGACT CTCTCTTTGT ATTTTGCTGA TGGTGTTTAA 360
TTGGATGATT GATGTAGTTT ATTTTGTAGT TCTCATTATT TATTTTCGGT ACTTCTGTGT 420
TTAAAGTTAA TAAAGTTATT GTTAATTTAA TTACATTTGT ACCTCTTGTT TGGGGTCACA 480
ATTCGATATG GGTGCATAAC AGGGATAATA GAGGAGACTC ACTCACAGAC TGACTGATGT 540
GCGCACAGGA TGAGACGGTA TCTTATATTT CCATTGTTTG ACGGACGTGT GTGACCATTA 600
AACACTTGCA TCTCTTGCAC CACCCTGTGT TTTTAGACGC CGTGTGAAGA TAACACAATT 660
TCAACTTCTG CCCACAGCAG TGCTCATTAA TGTCAGTTCC CGAGCAGTGG ACTCAGAGCC 720
TCTGTTTAAG GAAGCAAATC TGCATGACCA CGGCAGCATG GAGGAACCGC TCCTGAGTGC 780
TGCATGTCAG AGTGTTTTAA TTGTTGCACA GATGTGGAGT TTTCTGTCTA ACAGTGATGC 840
ACATCTGGAC TGACTGTATT CATCAGGGGA GAGCATGAAC TGAACCATGA GCCTCGTACC 900
ATGATGGTTC AGGATGAAAA CA 922