EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05225 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:44134161-44135122 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr11:44134817-44134833CTTTGTTTATTTAATG+6.48
FOXC2MA0846.1chr11:44134818-44134830TTTGTTTATTTA+6.18
FOXD2MA0847.2chr11:44134819-44134832TTGTTTATTTAAT+6.06
FOXE1MA1487.1chr11:44134818-44134833TTTGTTTATTTAATG+7.56
GFI1MA0038.2chr11:44134600-44134612AAAATCACTGCA-6.11
NFYAMA0060.3chr11:44134517-44134528GACCAATCAGA-6.14
POU1F1MA0784.1chr11:44134445-44134459GTCATTTGCATAAT+6.67
POU2F1MA0785.1chr11:44134447-44134459CATTTGCATAAT+6.62
POU3F1MA0786.1chr11:44134446-44134458TCATTTGCATAA+6.52
POU3F2MA0787.1chr11:44134446-44134458TCATTTGCATAA+6.52
POU3F3MA0788.1chr11:44134446-44134459TCATTTGCATAAT+6.22
SP2MA0516.2chr11:44134545-44134562AAGGGGGAGGGGCTTAC+7.19
SP4MA0685.1chr11:44134544-44134561GAAGGGGGAGGGGCTTA+6.04
Enhancer Sequence
TTAACCAGCT CTAGTTAATG TAGAGTCCAG CTGAGACAAA AGAATCACAT TAACAAAGCA 60
ATCGCACATT AATTCGCTTA AAAGTGCAGG TCATATGGGT TTGTCGAAAA ATATCTGTAG 120
TTTATAGTGT AGATGTACTG CAGTGTAAAC AATCTGGAAC GTTTTTAATA AAAAAAGTGC 180
CTGATAAATA CAGATTTTCG ATAGTCGACT CATTTGAAGG AGTCAGTTTG TGTTTTCCCA 240
AATAATTGGT CTGCTGCTGA TCTCTGTCAA CATAACCAAA GTAAGTCATT TGCATAATCC 300
CAACCCCCCA AGACATGTAA ACACCCTTAA AGCCATTAAA ACAGGCTTGA CCAGCTGACC 360
AATCAGAGCA CAGCTGTCTT ATAGAAGGGG GAGGGGCTTA CATACCTGAA GCCCTGAATT 420
GATTCAAATG AATCGTATTA AAATCACTGC AAAAGTTTCA TATTAAACAT AATATACTGA 480
CAAAATCACG ATGTTTTCTG ACTGTTAATG CATTTAAACA TGTTGTATGG GACTTGATAT 540
TAATCATAAA TAAGAAAACA CAATATTAGC ACATTTTAAA ATACTACATA TGACCTGCTC 600
TTTAAATAAA CCAAACATGC CAAGTGTGAA CACACCCTAA AATGTCCTAG AGTTTGCTTT 660
GTTTATTTAA TGGAGAATCT GATTTACATG TGATTTACAT ACATGTGCAT GTTACTTCTT 720
CCCTTTTCCG ACTAATAAGG AATCACACTA TCTAGTCTAC ATGTCGATAA CTTTTCCCCG 780
TATGATTTTG TCTTTTTTTC CCCCTCATGT AATTATATGC AGTATGTGAG CGGCGTTGGG 840
TGTTTGTCCT GGTGAAGTGT AGTTTAATCC GTCAGTCTCT CTCCGCTGTA TTCCTCAATC 900
TGTGTCGTCA TTGCTGAAGT CTAGATTTAC TAAAGCGAGG ACATTCGTTT CTTTTAGTTT 960
G 961