EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05224 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:44120028-44121302 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr11:44120205-44120215TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr11:44120205-44120215TCTAATTAAA+6.02
LMX1BMA0703.2chr11:44121278-44121289GTTTTAATTAA+6.14
LMX1BMA0703.2chr11:44121281-44121292TTAATTAAAAC-6.14
Nkx3-2MA0122.3chr11:44121159-44121172ATTAAGTGTTTTT-6.42
POU1F1MA0784.1chr11:44120251-44120265AATATGCAAATGAG+7.82
POU2F1MA0785.1chr11:44120251-44120263AATATGCAAATG+6.74
POU2F2MA0507.1chr11:44120252-44120265ATATGCAAATGAG-7.52
POU3F1MA0786.1chr11:44120252-44120264ATATGCAAATGA+6.18
POU3F2MA0787.1chr11:44120252-44120264ATATGCAAATGA+6.37
POU3F3MA0788.1chr11:44120251-44120264AATATGCAAATGA+6.02
POU5F1MA1115.1chr11:44120252-44120263ATATGCAAATG+6.32
Pou2f3MA0627.1chr11:44120250-44120266TAATATGCAAATGAGT+6.45
Enhancer Sequence
ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACACACAGAC AGACAGACAG 60
ACAGACAGAT AGATAGACAG ACAGACAGAC AGACAGACAG ACAGACAGAC AGATAGACGG 120
ACACACAGAC AGACAGACGG ATGGATGGAT GGATCTAATG ATCATTACAC ACAGAGTTCT 180
AATTAAAATA AATTCTATAT TAATTTTAGT AATTTAATTG AATAATATGC AAATGAGTGT 240
CTGATTTCTG TTATTCAGCG GATTTATTAT ATAAGAGACT TGCTCTTATA GAGGCAGCCC 300
TGTAATAGTT TTAAATATTC TGTTCTATTT AATGTTTAAG TTTTTTTTAC GTATAAATGT 360
GCGCAGATCT CTTCCAGGAT ATTTGATGAA AAACAAGACA AGGACACACA TCATCTAATG 420
CATTCATTTA TAGTTCTAGC GAGATTCTTT CTACTCGAAT GTACATTTAA TGACGCTCAC 480
CACTATCATA AATATCCCCA ATACTGAATA ATCCCTATAC TGTGATGATA ACCCCTGCAT 540
TCCCGCTGTA TTCCCTCATA TTCCCTGTTT TCTGCACCTT CCGTCAAAAC ATCTTTAAGG 600
TGTCTTTAAA GCATCCCTGG CGCATGCTCC CCTCCCACCC AATCAGCGCC GCCTCCAGCC 660
TGTCAGTTAG AAGCAGCGAC CAATCGGAGC GCAGCGTGAC GTTAGAGCTG CAGTGAGCGA 720
GTTGATAGGC GGCTGTCTCC GATCATCTCT CTCATCTTCT GATCATCGAT CTCCACACGC 780
GCTGATTGAT TGATTATTGA TTGATTGGTC GGTGATGTCG GTGCTGGAGG AGTACGAGCG 840
GGCGCCCAAG CGGCTGAAGG TGTGCTCTGA GGAGCTGGAG GACGGAGAGG AGTCCGACTC 900
AGCATCCGCC GAGGAGGAGC AGCGCTGGAG CTCCGCAGCC GAGAGGAAGG TCAGTCCGGC 960
GGGCAGCCTG CGCACACAGC CCCGCGCCAC ACTCTCTGGA GGAAACATGA CGCTCTTATT 1020
GACACGTTTA GAGTCCAAAT ATATGAACAT TCCTCAATCA TCAAGCATTT TATAGACTAG 1080
AGGGAAATAT TGTGTTGTTT TCAGAAATAA TAATTACATT TAATAGTCAA AATTAAGTGT 1140
TTTTCCTTTA AAATGAGTTC AGTAATCTGC CAGTGGGGTG AGAGACCTAA TGTTGTTTTC 1200
GTTTTGATGT CACATTATTC TGCACACCTC ACTGGCTGAT TATTTAGCTT GTTTTAATTA 1260
AAACTCACAT ATTT 1274