EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05215 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:44011493-44012643 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NR2C2MA0504.1chr11:44012002-44012017TGACCTCTGACCCCG+8.55
Nr2f6MA0677.1chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+7.03
PHOX2AMA0713.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:44011805-44011816TAATTTAATTA-6.62
RXRBMA0855.1chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+7.06
RXRGMA0856.1chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+7.01
RxraMA0512.2chr11:44012002-44012016TGACCTCTGACCCC+6.98
ZSCAN4MA1155.1chr11:44012325-44012340TACACACACTTAAAT-6.33
Enhancer Sequence
GCACACAAAA AGAAGATATT TTGAAGAATG CTGAACATCA GTAATCATTG ACTTAAATGG 60
TACTACAAAA GTCAATGGTT ACCTGATTTC AGCATTCTTT AAAACATCTT CTTTTGTGTT 120
CAACTGAAGA AAGAAACTCT TAAAGGTTTG AAACATGTAA ATGGTGAGTA AATGATGGCA 180
CAGTTTTCAT TTTTAGGTGA ACTGTCTCAT TTTGGATCAC AGTTTGTCTC CAGAATATTA 240
ATAATGATTT CTAATGTGAA GTCTCTTTAT TTTTGGATAT TTCGTGTCAC CGTCCTTTAT 300
GCATTGTTGG CATAATTTAA TTATAGATCC TTCATTTTGT GATGCGCCCC TGACGTTGAC 360
AGCTCGCAGA TTTATTTGCG AGACACGTCT ATGGTCATTA TGAGGCGGAG CTGTTCCCGC 420
GACAACAAAG GTCGTGACCT CATTGTGGCT GAATGCATCG TGTTATAGAT GTGTTTAATT 480
GGCGGGATGG AGAGGCTGAG GGGCGTGTCT GACCTCTGAC CCCGCTCTGT TTATGGAGGC 540
TCTTTACTGC TGCAGTGTGG GAGACAGTCA CTGTACTGCA CCTCCCCCAC ACACACAAAT 600
CAGCACGCAC ACACACTAAA ATCACTTGCA AACACACACG TGCACACAAA CACATACACT 660
CATCAACACA TGCACACAAA CGCACTCAAT TCAACACACC TGTACACACT CAAATCAACA 720
CAAATGCACA CGCTCGCGCA CACTCAAATG AACACACATG GACACAAACA CACACTCAAA 780
TCAACACACA CACTCCTGCA CCCTCAAATC AACATGCGTG CACACACACA CATACACACA 840
CTTAAATCAA CACACATGCC TACATACTTT AATCGACATA CACAATGCGC GCGCACACAC 900
AAATCAGTAC AAATGTGAAC ACGCATGCTC ACGCACACTC AAGTCAACAC ACACACACAC 960
TCTCACGAAA ATAAGGAAAT TTAAACTCAG GAAATTAAAA CGCACGCACA CTCAAATCAA 1020
CACATACAAA CAAACACATG CACACTTAAA TCAACACACA TGAACACAAA CACACACACA 1080
CTCAATTAAC ACACACTCCT GCACACTCAA ATAGGCATAC ACTCAAATCC AAACAAAATG 1140
CATGCACAAA 1150