EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05047 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:40446856-40447776 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MTF1MA0863.1chr11:40447327-40447341GAGCCGTGTGCACA-6.57
RFX3MA0798.1chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC+6.14
RFX4MA0799.1chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC+6.24
RFX5MA0510.2chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC-6.36
RFX5MA0510.2chr11:40447308-40447324TGTTGCCGTGGTAACC+6.54
RUNX1MA0002.2chr11:40447061-40447072AAACCACAGAC-6.62
ZNF143MA0088.2chr11:40447092-40447108AAATGCATCATGGGAA-6.76
ZNF384MA1125.1chr11:40447284-40447296GATAAAAAAAAA+6.02
Enhancer Sequence
TGGTTTTTAT AAAGTGTTAC AATTGACTAA AATGATAACT GGCTTAAATT GCATTTATTC 60
AACCATGTTT ATATTAATAT TTAGATGATT TAAGGATCTA TTTTTCTATA TGCACCAGTT 120
ATGCTCAAGT AAGTTTAAAC GCATTCGTTA ACTCCTCCAT TGGAATAAAA ATAATAATAC 180
GTTACATTCT GCTGAAAGAA TAAATAAACC ACAGACCAAC CGAGAGGAAG GAACTTAAAT 240
GCATCATGGG AAGAAAAAAA GCAGAGGAAG GATGAGATAA GACGGAGTGA TAGTAAATAG 300
CTAAGTTCTA GTAGTCAGAG TTTTCCTTTG TGCCAGAGGG CTCTCTGATT GGACAGTTTG 360
CCAGTGTGGG CGGTGCCTGT GAGTGGGCGA GAGCCAGTCG TTAGTTTGAG GAAATGAGCC 420
TGGTTTGTGA TAAAAAAAAA GGAGGGGGTG AGTGTTGCCG TGGTAACCTG TGAGCCGTGT 480
GCACACAAAA CATTTTCTGC AAATGGAGGG GGTTAAAAGG GGGTCGGATT TCAAAGCATG 540
TAAACTTCCA TCTTGAGTTG CGTCTGATGC ATTATCTGTG CAACTTTTGT TTTTGCAGAA 600
TGATGGAGAG TATTGGAGCA CAGAGATCAA AAGAGATACA GATACTTAAA GGGATAACGC 660
TGCTTTATGC CCATTTGGAT TATTACTATA AACAGAATAT TTAGCAGAGA CTGGGCTGAG 720
CAAATACGCT GATAAAATAG CAACAAGAGG ACGCCAATGC CTCGTCACAG TCTCCAGCAT 780
GTTGTACTTC CAGAATAAAA TATAAAATCT AACTTACAAA TGAACAGTTA GAACCAGTTT 840
TATGGATGTT CAATATCAGT GAGGTGTCAA TTTTGGTTTA AGCTTTAGAT ATTATTACAC 900
TGTAAAATCA GCAGTCAACT 920