EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-05038 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:40415998-40417089 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
LMX1BMA0703.2chr11:40416530-40416541TTAATTAAAAT-6.62
NRF1MA0506.1chr11:40416165-40416176GCGCATGCGCG+6.02
NRF1MA0506.1chr11:40416164-40416175CGCGCATGCGC-6.02
Rarg(var.2)MA0860.1chr11:40416092-40416109GAGGTCACGTAAGGTTA+6.57
Enhancer Sequence
TTCTAAAAAC GGTCCTACAA TAGATCTATT ATTTACTCAA TCGATTCAAG CTCACGCCTT 60
CGTGAATTAA ATCTATTGTT CGGACACACA TGTCGAGGTC ACGTAAGGTT ATTTCGTGCC 120
GTCTTGCCCC CTATGCCCCT TTTTATTCCC CGGTTACACT CGTGCACGCG CATGCGCGCA 180
CACGCGTCGA GCTGGAAACA AAAGGAGGTA GAGCGCGCGC CAAGACAACG TGCTCGAGAG 240
ACTGGGGGCG GGAGGCGCGA ACGATTTACA GCACGCGGCG GCGATATTCC CGCCTATTCG 300
AGCGGCAGAG ATCAAGAGCC CTGACTTTAC ACACACACAC ACACACACAG ACAAAAAAAT 360
TCAAAGAAAG AAAAAATGGC AGATGGTTCA CCAATTCACT CCCCCCGATA CCCTACACTT 420
AACGTTAATG GGATATGATT ACATATGGGA ATAGACGTCG AATTCACTTC TCACAGAGGT 480
TTGTTTCAAT TCTTCACTTA CTGTTGAATG AAAATGTTTT CCTTTTTAAC CGTTAATTAA 540
AATATGACGC GAATAAACGG AAAAATATTG CTAATTGAAG AAAATAACCA TTCACACATT 600
TCCGTTAAGT AACGTTATAA AAGAAACCGT TGAGAACACC TCCAACGTTA ATCGACAGAT 660
TTCTTTTTCT CTTTTTTATT TCCAGGTAAG CCCTTTTACA TCAAATACAT CGTATTCAGG 720
TAAACTTACC TTTGCGGTGA TCTCGGAGGT GGTGGTTGTA TCAACAGCGG TATCGGCCAT 780
GGTGGTTTAT AGAGATGATT TAAAGAAAAA TGTCCGAGAA AGCGTTAAGA GAGGTGGGAT 840
GAGGTAGGAG ACGGTCGGTC GGACGGACGT GAGGAGGAAG AGTGAATCAA AACTGCCTGA 900
ACCTGAGAAC TGAAAGGCAC GTCGAGCGCA GCGGCAACCA CACTGATATC TGATTGGACA 960
GGAGCACAGC AACGTAAATC CGTTCTTTGA TTTGATTGGT GAAGCCACTG TCGATTGTCC 1020
TCCCCTTTGC CCGCCTCAGT GTAGTGCGTC CTTCTGGTCT TATTGGTGGA ATATATAATT 1080
TGACTCTTTA C 1091