EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-04616 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:28308144-28309304 
TF binding sites/motifs
Number: 2             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
RARA(var.2)MA0730.1chr11:28308601-28308618GGGTCATCTCAAGTTCA+6.23
Rarb(var.2)MA0858.1chr11:28308601-28308618GGGTCATCTCAAGTTCA+6.01
Enhancer Sequence
ATATAAACCA CGAATCAGAG GATAAAAACT CTGAATTGGG GGATAAATCT CAGAACTGCA 60
AGAAAAACCT CAAGAATTGC AAGATATAAA CTCAAAATTG TGAGTGAAGT TATAATTACA 120
AGATACAAAC TTAAAATTAC AAGATAAAAA TAAACTAATA ATGGAAAGAC AGTCCTGCAA 180
GAGGATCACT GGTGTCATGG AGGTGTGGTA AACATGGTAG ATCTCATCCT CCTGTCAGAC 240
GGAGTGGCCG TAAATTGGTT GACAATGTTT GGATGGGGGT TGGAGTTGTG ATGGAGGGGG 300
CGGAGGGGGC TGTTCTCTAT GCAGATGTCT ATTGAATGCA ACTCCAAGAC CAAAGGAAAT 360
AGGAAATTCA AGGAATGATA GCAAGGCTGG GGGAAGGACG GGAGGGTGGA ACGGTGCAGT 420
GGCCTGTAGA TGAACCCAAC GGGGACTTCG CTTAGCAGGG TCATCTCAAG TTCAGGTCTT 480
TCCCTGGCGG ACTGAAGATA CGACTCCTTG TGGAGGCATG AGACCTAGAT TGGAGCCCCT 540
TTAGATATCT TATCATTGAA ATTCTCTGCC TGGATTTAGA ATGTTGGGAA AGCTTCTTTT 600
GCATTCATTT ACAACTCATT TGGTTGACAG GTTTACCATA TTTGCCCCTT TCAAGAGATG 660
TATTTTATAT GGCATGGCTG TCACGTGCAG ACAGCAATCC AAATGTAGTT TTTACAAAAA 720
GGAAATCTAA ACTTAGTATA ACACATAGAG CAAAATAATA CAACTCAATA AGCAAACAAA 780
GGGTAGGTCA TCTTAACCAG TGGTCCCCAA CCTTTTTATC ATCGCGGACC TGTCAACGCA 840
TGACAATTTT ACATCGGACC GGGGGATGGG GGGCAGTGGT TCGTAGGTTA CTGGTTTTTC 900
AGAGGATGAC AAGCTGACAA AACATTGCTG TCACTCTAAT ACAAGTTTTA TTTATGGAGA 960
AAGCACTGCA GTGTTTGGGT GTTGAGTGTT TGTCTGAGAT AATTAGAGCA CCAAAATGTA 1020
CATATTCCAT ACAAGCTGAA GCTGAATGGC CCCTAAAAAG TTTGCAGTCA TTTGCAGTCT 1080
CCAGCAGTTG ATCTTCTTGC ACAGACATGC TGAATTTACC AGATTTGTTG ACAAATGGGT 1140
TGCAGATCCA TTCCTTGGCA 1160