EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-04493 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:25171907-25173197 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr11:25172761-25172778GCCTTTATTTACCTTCA-6.25
POU2F2MA0507.1chr11:25172906-25172919TTCATTTGCATGT+6.92
RARA(var.2)MA0730.1chr11:25172132-25172149GAGTCATCCAGAGGTCA+6.13
Rarb(var.2)MA0858.1chr11:25172132-25172149GAGTCATCCAGAGGTCA+6
Enhancer Sequence
CCACTCAGAG CATTATGGTT CAACGTTTTA AACAACATTT ATGGACACAC CACTTTATCA 60
AAACAGTGTT TTTGGATATT GTAGGTGTTT GCAGAATTTA AATATGATTG GTGTGACAAA 120
TAGTTTGAGA TGAGATATTT CTGATTAACA TATCAGTAAG TACAGTTACG ATTCAATGTC 180
AAAATCATGC AAGCCTGTGC ATTTCATTTT AAGTTTTAGA TTTTTGAGTC ATCCAGAGGT 240
CAGGATTAGG TCATGTCCAC AGATGTTCAC AGTTACCCTT GAGAAGTGAT CTGTTTTTCA 300
CCATTGCACG TGACTAATGA TCAATCATGC AATGATTTTA CCTCAGTTAA TGTAAGCATG 360
CAAATTATGT ATTTCTGGAC TTTCTCCATT AAGTAAGGTG TATTTTAAGA TCTTGCTGAG 420
TAACAAAATA TTGCAGGTGC TTGTTTTACA TTAACATTTT TGCTGTGTGA AAATTTTAGT 480
TTTTATGTTA AAACCAACCA ATTAATTATA TTAATTTAAA TTTCTGAGCT ATTCAGCATT 540
TTTGTAAGAG GATCCTGTGG AAGGTAGACA TTTTATTGCG ATTTCAGCTA AGGCCGTTAC 600
TGCAGACGAG AGTTTGTTGA GTGTTGTTGG CGTGATTAGA AGAAAATAAT AATTGTATTA 660
ATAACATCAC CTTAAATTAA AGAAGCGGCA GTTTTCCAGT CCGGTAAGGT AAGAGTCGAG 720
TTAATTACCT TTTTGTCGTG TGTTTGTCAT TAAGTTGTAA GCATGTCTAC GTGGTGATGT 780
ATTTATATTA AACTTATGCA GTCGATGAGA TGCATCACAC AACTGTAAAG TAGCCTACAT 840
CTTCCAGTGC AGGTGCCTTT ATTTACCTTC AGTTGTGGCG CGTGAGCCCT GGCAGTACAC 900
AGATACGCAG TTTTTCCGCC TGAGCTAAAT TTAGAGCCTG GCACAAATGT AACCTGGGTT 960
AAATGCTTTG TCGCCCTCCG CCAGCTTTAT GGAAAGCGTT TCATTTGCAT GTTCATGCTC 1020
CAAAAGCAGA TCAATTGTCA AAGCCTCTGC AAAGTGGATA AATAGACAAA GACACTATTA 1080
TTGCATAGCT GCAGTGACAC GAAGTCTAAA TAGTGAGCGT CAAACCACAA TGTCTAAAAC 1140
AGTTAACGTT AGCAAATTTA AATATCATCA TACTGAAAGT GGTCACTTAT GAAAGTTAAG 1200
GTTAAGTGTA CCGTAACCAA CACGCTCTTT TACAGCATGC ATCAAACTTG CCACATCTGT 1260
TAAGTCAATA AAGAATATAA TAGTTTTAAA 1290