EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-04207 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:18544374-18546916 
TF binding sites/motifs
Number: 22             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CREB1MA0018.3chr11:18544560-18544572CGTGACGTCACC+6.32
CREB1MA0018.3chr11:18544560-18544572CGTGACGTCACC-6.32
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr11:18544560-18544572CGTGACGTCACC+6.27
CREB3L4(var.2)MA1475.1chr11:18544560-18544572CGTGACGTCACC-6.44
DMRTA2MA1478.1chr11:18546737-18546749AGTTGTTACATT+6.04
FOXB1MA0845.1chr11:18545880-18545891ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr11:18545880-18545891ATATTTACATA-6.62
Foxj3MA0851.1chr11:18546064-18546081TTGTTTGTTTATATTTG-6.41
LMX1BMA0703.2chr11:18545825-18545836TTAATTAAATT-6.32
Lhx3MA0135.1chr11:18545822-18545835TAATTAATTAAAT+6
Lhx3MA0135.1chr11:18545819-18545832GAATAATTAATTA-7.12
PHOX2AMA0713.1chr11:18545826-18545837TAATTAAATTA-6.62
POU4F2MA0683.1chr11:18545817-18545833TAGAATAATTAATTAA+6.14
POU4F2MA0683.1chr11:18545039-18545055ATGCATAATTAAATAG+6.84
POU4F3MA0791.1chr11:18545039-18545055ATGCATAATTAAATAG+6.32
PROP1MA0715.1chr11:18545826-18545837TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr11:18545826-18545837TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr11:18545826-18545837TAATTAAATTA-6.62
ZNF24MA1124.1chr11:18546045-18546058CATTCATTTATTC+6.5
ZNF24MA1124.1chr11:18546872-18546885CATTCATTCATTT+7.34
ZNF24MA1124.1chr11:18546864-18546877TATTCATTCATTC+7.52
ZNF24MA1124.1chr11:18546868-18546881CATTCATTCATTC+7.82
Enhancer Sequence
TGTTTATTTT CCTTCAATGA TGGTCTCTTT GTCTTTCTTT AAATGCGTTT CCTCGCGCAA 60
ACTTCCAAAT TCCTTCATAT GTGCGCGTCG CCTTGAGCGC GCACTCGCAT AACTTTGCAT 120
TGCTGTGCTC TGATTCTTCC CCCAGATTGT CCAAACAAAC CGAAGCAGAC TGCCGGGCGC 180
CAGCGCCGTG ACGTCACCCA TTCATTCGAG CCTTGACGCC TGTCAGCCTG GCGCCGAGCG 240
GGCGGTCCCT ATAGCAACAA CAAACAACAG GCTGGCATCC CTCCACTCTC CCCCATTCAC 300
CTGCGCGCTG CGGAATCCTG AGAACAAACT GGTCAGCGCT CATTTATCAC TTAAAACCTC 360
TGATGCGATT ACCGCTCCGC GCACCTGCAA ACTGCCATTG TCGTCCCGAA AGACTCTTGT 420
AAAGACACAA AAAGTGAGAG ACAAAGTGAA AAAGGGCTAT TGAGCCGGAG GGGCTTTTTT 480
TTAGATTCCA GCAATGCTTT TATTTTATTG TATAAAAATA AGGCGAATGC TAATTATTTT 540
TAAATGCTAA ACTTTATTTA AAAATACACT AAGTATTAAT TAAATATAAT AATTGGTAAA 600
TTAACGTTAT TTTTTTATAC AAATCTGTTG CATATAATGT TTTAAATAAA AATAAACATT 660
ATAACATGCA TAATTAAATA GGTCAAAATG AAAAAGAAGC AATTTTGTGA CAAGAAAATG 720
ATAAAACACT GATAACTCGC AATGTGCAAC GACAATTATT ATTATTTTTT TAACACTTAA 780
AATAAAATCT AAATGCGCGT GCATGGATTT GTGCACGTTG TTTTGAGCGA GTGCATAGCT 840
CTGCATCCTG CAGGCAGGAG CGCGAGGGAC TGGAGCGTTT CTGGCTCGGT CACAGCTGAG 900
CGGGGTTGAG GGGAGGCGGA GGAGGAGCTG AACAATGGGA GTGCAGTATC GGGACTGTGA 960
GAGAGAATCT CGGCTGGAGC CGACGAGTCT GGAGCGCCCC TCCACTCGCT CATCCCGCTT 1020
TTGTTCAGCT GCGCAAGCTA TCAGCACTTC CTACCGACTC CAACAATAAG CCCTCACAGC 1080
TGGGCTCTCC AAAGCCTGTT TACTGCACAT CAAGGCAAAG AGAGGCAAAG AGTGTAACAT 1140
CCCCCTTACA CACACTCACA CACCCTTATG AACTCTGGTA AAATATAAAA CATATTCCTA 1200
GAAGCAGAGA AAGGACGTTC AAAGGAAAAA GTTACAAATT ATATATGCTT TATTGCTCAA 1260
TTACCTCATA TGCTGGCCAC TGGACAACAA CCACTCCTTA CTTATTTGTT CAGTAAAACA 1320
TATGTGATGT GCATCAAGTG AGCCTATGGT TTTTGTACAG GACCATTCAA TAATTTATTT 1380
TGCATATACT GTAAGACCAA TTATAGAAAG TTATTCAGCT CTGCCAATGG TTTAAGACCA 1440
GGATAGAATA ATTAATTAAA TTATTCATTC ATAATTTGTG CCTATAGTTG CAGTAGACAA 1500
TACTGCATAT TTACATATTT AAAATGAACT TTTAGATACC CGTATAACAA GGAAACTTTT 1560
TATTTTTATT ATATTTATCA TTGCAGTATA CAAATAATAT ATTGAAATAA CGTGAATTTA 1620
GATGTAATAG AACATAATTT TATTCAATAT ACTCAACTAG AACACAGAAA TCATTCATTT 1680
ATTCTTTCAT TTGTTTGTTT ATATTTGTAA ATGCAGCTTA ACTGATGAAC TAAATTACAG 1740
AAACCATATA GTTCTTGTCC CGATTACACT CTGACCTGAC TAGTTGTTTC TCACAATATG 1800
TCAGAGAGCA GGAAAAAGCT GGTGCGGCTG GTGTGAATAC TCGTCTTTTT CTTGTAGCAT 1860
CTGCATGCAT CTTTGACTTT TCCCTCTCAT GGGAAGAGTG GCCTCAGATA ATTGTCCTCG 1920
AGGGAATCGC ATCCTGTCAG AAGTCATGTG ATCGCTGTCT GACAAGGCTG CAGTGTTCTG 1980
TGCTGTGTCA TCAGCTGGCT GTGAAGTCTT TAATTCACAA CATCACAGCG ACACAAAGCT 2040
GCAGACACAG AAGGGAAGTG TTCAATGCAA AGTGCAATAA GACAATGCAG TTCACTAGGA 2100
ACAGACCTAA TTAGCTTCTG TGAGTCATAC TATGACATAA AATCAACCTG AATAGCTTTT 2160
CACGACACGT TTGACTTCCG TAACATGACA TATTTCTGAT ACTGAGTAAT GAGGAAAAAA 2220
TGTAGTGTGG GAATTGAATG CATCCAGTGG GAATTGATTG GATGTTGGCC ATAAAATATT 2280
AGAATGAGGC TATGAATAAA TGCAAGTTTG CTTATGGATG TTGTTTTGAT AATCAGCAAG 2340
GCCTGGTGCC AATTGAAATA CAAAGTTGTT ACATTTGTAG TTATTATTTT AAGGTATACA 2400
TTTGAGTTTC CGGGTTCCCT CGCTTCTTGA CAGTACACTT TAAAAATTTA ATGACAAAAA 2460
GTCAAGGCAA CAAATCTTTT TATGCTGCTT TATTCATTCA TTCATTCATT TTCTTTTTAG 2520
CTTAGTCCCT TTATTAATCT GG 2542