EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-04130 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:16259814-16260966 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HOXA13MA0650.2chr11:16260281-16260292GCCAATAAAAC+6.14
HOXB13MA0901.2chr11:16260281-16260292GCCAATAAAAC+6.14
HOXD13MA0909.2chr11:16260281-16260292GCCAATAAAAC+6.14
SOX13MA1120.1chr11:16260033-16260044AGCCATTGTTT-6.14
YY1MA0095.2chr11:16260328-16260340GCCGCCATTTTG-6.92
Enhancer Sequence
TTTCTGTCAG AGTTTCCAAA CTTATAACAG TAACTAGCAT GTCATAACCT GGCAGGTCAC 60
ACAACCAGGC CAGAGACTAC TTACAACCAA TACCTTGTTA TGATTTTATT GGGCAGAAAA 120
TCCTCTGTCA GTACTTCAAG GTAATTTTAA ACGTCTTATA TTATTTATGA GACAATTTTA 180
GAATTGGCAT TTTTGTCGTT TGATATTCTA TGACTTACGA GCCATTGTTT CGTCAAATGA 240
CAACTTTAGC TTGGTGTTTA GTAATTGAAA GCGTGTTGTT TAGGTGTTTA ACAAGGCATT 300
TGGTTCGGAC TGGACAGTTT TGTGTACTTA CAGATGCACA GTGCTCTTTG GCAAGTCTTG 360
AGGGACATCA GTCATGTCCA AACGACTGCA GTCGGTCGTA TCAAGCGTAC ACGTACAGTT 420
TTGAGGACAC GGTGCGCCAT AATTGATTAA CAGTTCCAGC GTCAAAAGCC AATAAAACAC 480
ATGATATGAA AGTGATCCCA TCTGTCCCAG CCACGCCGCC ATTTTGTATC CAGTTGTCTC 540
AGCGCTTAAC GACTGATCTC TCTCATCCAC AAACGGACAG CTCGAGCTTA TTGAGTTTCT 600
CAGAGTTCGA GTAATTCGCC TTCATTAAGT TGTTTGTTTA CCCAGCGGTA CTATCAAATT 660
ATACTGCGTT GCTTTCGGGC AATGCATCTG CCCTGAACTT GAAAACAGTC CCACAGTTTG 720
AAAAAAAATC TCCTCTGCAG CACCACGTAA GTAAATCAAA GGTGAATCAC GACGAGGCAA 780
TACAAGAAAC TTGTCCAGTA GCCAAAACTA AATGCAGTTG TCCTTAAAAG GTTGAAAAGG 840
GGGTCTGTAT GGGGGATAGA CGGGCGCTTT GTTTTGGCAA GAGCGATCCA CTGAATCAAA 900
TGTAGTTTGA GGAGTTTAAA TTGTCCACGG TGTTTCTGAA CTTCTTATAA TGTTTTGATC 960
CTAAGGGATT CATTATAACG AAGAGTAAAC ACATAGTAGA TCGTGTCCAT TAACTCCACA 1020
CGAGCGCGTT GAAGGAAAAT CTAGGATCAT CGGCGCTTTA AAGAAACTTT TCCACAGGGA 1080
AAACCGCACT CTTTAAAAAG TTTGAGGCTC TCGTTTCTTC TTACAAAGTA TCCAAACTGC 1140
GACTCCACGA TC 1152