EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-03762 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:6489475-6490155 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr11:6489694-6489707AAATTAATTAACA+6.19
RFX3MA0798.1chr11:6489525-6489541TGTTGCTATGGTAATG-6.09
RFX5MA0510.2chr11:6489525-6489541TGTTGCTATGGTAATG-6.23
RFX5MA0510.2chr11:6489525-6489541TGTTGCTATGGTAATG+6.2
Enhancer Sequence
AGTCTTTGTA TAGTAAAATA GCTTGAATAA ATCTATGTTG GTAATTCTAT TGTTGCTATG 60
GTAATGCAAC AACTTTAGTA ATAGAAACAA ATGATCAAAT ACTGCAGTTT CCTACCACTA 120
TATTTCATAT TAGACCACTA CAAACCACAG TTTACTGCAA AAACACAGTA TTTACTACAG 180
TTCATCAGTT CACTAGAGTT AATACTACAG TATGCTGCAA AATTAATTAA CAAAGAGTCG 240
TCAATATTAC AATATATACA GAACAATACA CTTTTAAACA CTTAGTAAAC ACTGTTTTTT 300
ACTGTATAGT ATTTCTTTAT GTGGGTTATT ATTTTTTTTA CCTCTAAACA AGTAACTCAG 360
GCAACTTTTT TGAGTAAACA TGAGGAACGT TTCCAGATTA GCTTACAGAC TCCATTGCAA 420
CAGTGGGCCG ACAGCTGGGA GCAACTTAGC ATGCACTGTA TTTGCAGCAA CAACGTGTGT 480
TTTTTGTGTG TGTGTGAATA TCATCAGGAG GACAGGAAAG ACAGACACAC AGGAACTAGG 540
CCGGGGGATT GGATTCTCAC TCCTCTGATC TGTCCTCCTC CTACTCACAC TCTCCTCCAC 600
GTCCTGTGCT TTAATGAGCA GGAACAGGAA GACAGTAGTG ACATGGGGCT CGTGAGGGTC 660
ACGGAGCAGA GCTGCTCACC 680