EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-03746 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:5819728-5820874 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr11:5819872-5819884AAAAAAACAATC-6.44
HNF1AMA0046.2chr11:5820853-5820868TATTAATAATTAAAT+6.2
NFYAMA0060.3chr11:5819956-5819967TCTGATTGGCT-6.32
NFYBMA0502.1chr11:5820635-5820650ATCTCGACCAATCAG+6.58
Enhancer Sequence
TTTTTATTTA TGAACTTTAA ATTGTTATTA ATGTGTTACT TCTCTGCTAG TAGCTGTATT 60
GCCTATTTTA TAATTATGAA TATTTTATAT GTCGTATATA CTTTTTCGGG GGTATTAATA 120
TAATTTTTGG CCATTATTTA AAGAAAAAAA ACAATCCTGT CAATGTGACT TCCGCATCAC 180
GTTGCGCCGT TGTCTTTTAG AGCTCCGCCC ATCGCTTCGG GTTTATGTTC TGATTGGCTA 240
AAGCTCGCTT ACGTTTGATT CAGTTTAAAC TGGGGTCAGG CTGTCAGGCT GTCTGGAAGT 300
GAAAACGGCG AGATCAAACT GATGATTTAA TTCATGGAGA TTGATGCGAT TCTTGTAATT 360
TTACGGTTTC CCTGAGAGTT TGAAGTCTCC GTGTCTGTTT ATCCGGTCTT TTTAAATCAG 420
GATTAAAGGA AAATGAGGCT TCGCTCGAGA ACTGTTTTAA ACGAAAACAC AACGACACCG 480
ATTCGCCGCC GCCGAGCCGC TCCGGAGACA CCGAGCCGGG AGAACGAGCC GGTCCAGAAC 540
CAGGTCAGTC CTGTTGAATT GTACAAAACA AGTGAAAATA AACCAGGATT TGTGTTTAGA 600
TGCGATTTAT CGTGTGATTT CGTATTCAAA AGGATGTATT TAGGCCTAGT TAGCATAATG 660
CTAACAAGAG ATACGGCGAG CGAAATTAAA CAACGTTCCT CTGATGATGT TTCATTAAAA 720
TATCATTATT AGATATTAAT ACATGTTGTT GTTCATGCGA ATGATGTAGA TTTGTGTATA 780
TGAACATAGT ATTGGATGCT TCTGGTAAGT GTTTTGAGTG CTGTCCCACA TATGTTTAGA 840
GGCGGAGCCT ATTCTCACTG ATTGTCCAAT AGGATTCCAC TATTTAGAAA GGTATTTGGG 900
AAGATCCATC TCGACCAATC AGCTTCTCTG TGTATTGGCG CTGAAGAAGC ACATGGAAGT 960
GTTTTTGTCA TTAACACCAG AAATAGTACA GAATAAATGC AGTTAACAGG TTTTGTATGG 1020
GTCCTGGAAA TCCTTGAAAA TAGTTTAGTT TAATAATATA GTGTTTTCTC GTTTTAAAAA 1080
TGCATATATT TTGCCCTAAG TGCTTTTTAA TTGTTAATGA ATGGGTATTA ATAATTAAAT 1140
TGGACA 1146