EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-03723 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:4924580-4925496 
TF binding sites/motifs
Number: 12             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DMRT3MA0610.1chr11:4925185-4925196ATTGATACATT-6.62
DMRTA2MA1478.1chr11:4925184-4925196TATTGATACATT+6.02
DMRTC2MA1479.1chr11:4925184-4925196TATTGATACATT+6.52
FOXB1MA0845.1chr11:4924798-4924809ATGTTTACATA-6.14
FOXC1MA0032.2chr11:4924798-4924809ATGTTTACATA-6.32
FOXC2MA0846.1chr11:4924797-4924809TATGTTTACATA-6.14
HNF1AMA0046.2chr11:4925113-4925128TTTTAATCATTAACT+6.2
HNF1AMA0046.2chr11:4925113-4925128TTTTAATCATTAACT-6.73
HNF1BMA0153.2chr11:4925114-4925127TTTAATCATTAAC+6.07
HNF1BMA0153.2chr11:4925114-4925127TTTAATCATTAAC-6.48
MIXL1MA0662.1chr11:4925476-4925486GTTAATTAGA-6.02
ZNF143MA0088.2chr11:4924986-4925002CAGGGGATTGTGGGAA-6.17
Enhancer Sequence
TTTAATAGTA CATTTAAATA GGCTACAACA GTAAATACTA ATAATCAACT AACATTTGTT 60
GCATTCGAGA GTTTTCTTCC CCTCTCTAGC TTTAACATGC CTGAATTTAT GCGATTATTT 120
TCATTAAACT CACTGCCACA CATCTTGCTG AGCAAGACTC ATCAGCATCA CATGCATCTA 180
ACTGATTTGC ATGACGCTGT CACAAAATAA AGAGTAATAT GTTTACATAT GCCTGGCGCG 240
GCTGACATAA CGCGTGAAAC AAGCTATCTA TCACCACAAT ACATTTACAT AAACAGCACA 300
TACGCATTAT TAAACAGGAA TTTAAAGAAC CCCCCCCCCC GCCGAAATGA CATCTCACAT 360
CCTCCACACA AAACACATGT ACTCACCTTC CGCATCGATG GTTGTGCAGG GGATTGTGGG 420
AAGCGTAGTT TTTTTGGTTG CCGCGGAAAC CAAGCACAAT GCACCATAGA ACTACATTTC 480
CCATCAATTG TTAATCATTC ACATTGACGA TGTGCAATGT AAAGTCTTTA GATTTTTAAT 540
CATTAACTTC AGTTTTTACT TTCTTTTTAT ATGTTAGATG CTGCTCTGCA TTATTAAAAT 600
TGCATATTGA TACATTCCAT GAAGTTAGAG TGGATACATT AATGAAAAAT AGCTTAGCAT 660
GTGCTAGCCA GGTTATAAAA TATGCTTTGT ATGTTTTGTA ACTCAGTTTT TTTGTCTGGT 720
GCAATGACAT GATTTTATAT TTAACTTTTT TTTTTCAAAT TCGCCGTTAA AGAAAAGTCT 780
TGACTGCTGC TGTCAACAAT ATTAGACATA AATAGGCTAC TTCCAGTAAC CCAGAAGTCA 840
TTAAGTGTCC GAATGCAGTG AACCGATTGA TTATTGTACA AGAATTGATT AGCTTAGTTA 900
ATTAGAACGG ACAGCT 916