EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-03616 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr11:1601720-1602780 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Myod1MA0499.1chr11:1602450-1602463AGCAGCTGTTGCC+6.34
NFYBMA0502.1chr11:1602497-1602512ATATGAACCAATGAG+6.27
Tcf12MA0521.1chr11:1602449-1602460CAGCAGCTGTT-6.32
Enhancer Sequence
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 60
TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA TCTATCTATC TATCTATCTA 120
ATCTCCCATG AACTGTTACC AACGATTCCT ATAGCGAATC GGTTCGCGCG AAGTGAACTG 180
ATTCACGAGT CGAACATCAC TAGTAGAGGA TTGGACCACA CATTTCGCCC AATCCGTGTT 240
ACCAGCAGCA ACAGAGAGAA TCGGGGTTTG CATTCATAGG TGTGATCGGC TCGGAGCGGA 300
GCTGGCGCTG GCTGTCATCC GCAACAAAGC ATCGGTCTGA GCGCCTTTTT GATGCCGAGG 360
ATCAGACCCG GATCATCCAT AGATCGAGCT ATGCATTCAA GGAATAGGTG AATCGTGCGT 420
GCCAGGAGAA ACCGTTTGCG CCAGAGTGCG CATTTGGAGA GGCGCATCAG ACTGCAGCTT 480
CAGGGATCAT CGGACCTTGC TTTTTTTGTT TCTGGCCTTT TTATAAACAT ATTTCTCTCT 540
GTGTGTCCTG TTGAAATATG ATGTTGCGCT CCACGGCTTG CAGGCTGCTT GTCGGATTGT 600
TCTTTTTGGG GGTTTTGTAC AGTTTGGAGG TGGTTCTTCC TGCAAGGGCA ATAGATGGTG 660
AGTGTATGAA GATGTTTTTA TATATTTTTA ATATTATGGC ATGCTGTTTA TCATCATGCA 720
TTCATAATTC AGCAGCTGTT GCCGTGCATT TATTCAATGT ATATGTACCA CCAGCGAATA 780
TGAACCAATG AGACATAAAG GTTGTGTGTG TGAGGTATAA TAATGGGTTA GATAACGGTT 840
TGAAGTAGCC ATCCGCATAA CACACATCCA TCCCAGGAGT GCTGATGTAC ACGGATAATC 900
AGTGGCTGAA CAATGACAGC GGCGCACATG AGCAGAATAC ATGCAACTTT TCACATCAGT 960
TCTTTTGCGT GTGAAATCAA ACCACGAGTC ATAATGGCAA TCTGGAAATG GGAATATATG 1020
GACGTGAGCT CGCAGCTAAT TAATAGGGTT GTCATTTTCG 1060