EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-03328 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr10:39123246-39124380 
TF binding sites/motifs
Number: 6             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr10:39123835-39123846TAATCTAATCA+6.32
DUXAMA0884.1chr10:39123834-39123847TTAATCTAATCAC+6.22
DUXAMA0884.1chr10:39123854-39123867TTGATTAAATCAA-6.44
ONECUT1MA0679.1chr10:39124142-39124156AATATTGATTATTT-6.17
ONECUT2MA0756.1chr10:39124142-39124156AATATTGATTATTT-6.23
ONECUT3MA0757.1chr10:39124142-39124156AATATTGATTATTT-6.41
Enhancer Sequence
TGTTGTTTTT ATATATAAAC ACAGAAAACA CTGATGTAAA ATTATACCTG ATATACTTAA 60
CAAATAACAA ATCCTGATAA TCTGACTAAA TCTGATAATG TCAGATTAAT GTGGAGCACA 120
TTGCAATATC TGTACTTTTG CCGCCCTCTA GAGGCGTAGC TCGCTCCTAC GTGTAAACGT 180
TGGAAGACAA CATTAGAAAA TGGCGCATTT TCGGCCTCTG TCAGACATAA ACGCATTTTG 240
ATTCGTAAAC GAAGCCATTT TCAAAAACCT CAACGTGTCT GTCAGATCCC ACTGTATATT 300
CTCACAATAT ATAGTTCATA TATTCATTAT GATATAATAA ATGTTCGCTG TTGCAGGCTT 360
ATTTTGGATG ATGTGAATCT AAAACACTAA CAGCAGCCCT GAAGGCAATA AAGACCCCCA 420
GTGCTAACAG GAAATGTTAT ATGGACTGGG GGAGGGGAGA AAACAAGACA CTCTTTGGCC 480
CTGAACACGT TTTTAAGGCA CTAAAACAGT AGCACTAGTC TTTAAAACCA CAACCATGTC 540
CCTCATTGTT ATAATTTAAA GTTACTGACT TCCACACCAC GACCCTCATT AATCTAATCA 600
CTTAACCCTT GATTAAATCA ATTGTGAAAC ATTAATGTCG GTCACAATAG AAAAGTTGGT 660
CAGCCATGTG GTCATTGTCT TGGACGCATC ACTAAGAAAT CTCTAAAAGC TGTTAAGAGA 720
GTCGACTCTT CAGTTAAAGC GATACTCGGG CACAGCAGGT TCCTAAGCTC TACTAAGCAT 780
CAATCTCCAA AATCTCCAAC ATGTGGTCTC TGTTTACAAC AACATTACTG CAATGTGTGG 840
GTGTTTCTCC TTAAAATGCA CAGATTTAAA TGCATTCTAT CTGTATTATA CAACACAATA 900
TTGATTATTT AATGTTAAGA TGACAAGAAA GTCGCAGCTT TTATAACTTG GAGCTGTTTT 960
GGAAAGCATG GTTTGGATTT TAAAGGAAAA TATACAGTGC CCGGCATGAA TGAGTACAGG 1020
TTTTTCTTTT AAATTAATAT TTTGTGTAGG ATGCTACATA AAAATAATTG ATTTGTGTTT 1080
GTCAATAGCC TACCAAAAAC TGGAACTGAT CTAACAAAAT AACCTAGAAT CAAG 1134