EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-02676 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr10:20630107-20631229 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr10:20630267-20630278ATATTAATTAA+6.62
FOXC1MA0032.2chr10:20630417-20630428TAAGTAAATAT+6.14
FOXE1MA1487.1chr10:20630348-20630363ACTAAAATAAACAAT+6.02
Foxd3MA0041.1chr10:20630429-20630441AAACAAACATTT-6.27
Foxq1MA0040.1chr10:20630375-20630386CATTGTTTATT+6.02
Foxq1MA0040.1chr10:20630353-20630364AATAAACAATT-6.02
LMX1BMA0703.2chr10:20630270-20630281TTAATTAAATT-6.32
PAX6MA0069.1chr10:20630151-20630165AACTCATGCATAAA-6.07
PHOX2AMA0713.1chr10:20630271-20630282TAATTAAATTA-6.62
PROP1MA0715.1chr10:20630271-20630282TAATTAAATTA+6.32
PROP1MA0715.1chr10:20630271-20630282TAATTAAATTA-6.62
Phox2bMA0681.1chr10:20630271-20630282TAATTAAATTA-6.62
YY1MA0095.2chr10:20630951-20630963CAACATGGCTGC+6.14
Enhancer Sequence
CTGCTCGAAG TTATGCCAAC TTTTTAAGAT TTTTTAAAGA GGAAAACTCA TGCATAAATG 60
AGATTTTGTA ATTGGAATCC AATCAAAGCT GTGCAGTGCC ATTTTCGTCA CATTAAATTC 120
CTTTGATTCA CCGTTAATTT CATCGCACAG AAATGCATTA ATATTAATTA AATTAAATCA 180
TATTTTGCAT GTCTCGTTGA TTTTATACGC GTTTTCACCA ATTAATCTGT CTCGATAAAC 240
AACTAAAATA AACAATTATA TTCAAAAGCA TTGTTTATTT TTTCAGTTTT GTGTCATTTC 300
GAATGTCTAT TAAGTAAATA TAAAACAAAC ATTTTAAGAC ATTCATGTAG CAAAACAAAC 360
CCATCGATCA ATGCCACCGA ACAACAAATG ACCTTTTTTT AAACAAACTA AGCTGAAACA 420
TTGTTTCATC TCAAAGAAAC AAACCTGCAA TGACCAGCTG GCTAACATTA GCCTGCTAGC 480
GTTATCTGGA TAACAAAACA GATCGAGTAT ATCCATATTG TCAATGTATA AACGCTTCAA 540
TCTAACAGTA AATACAAAAT GAAATACGAA TAAACTAAAT TAAGCACTCG TGAATAAAAA 600
ATAAATCCTG GGCTTTCAAC AGCAATGTAA AGCGGACCCC GTGTAATGTC GCTGCATTAT 660
ATGAAAGGCG GCGTTAGCGG ATGTGCTAAT GTGTGTGTAT AAGGGAAAAA CATCAACACA 720
CGTAGTTCTA ATGTGTATCA CCAGGGGTTT TTTAACAGGC GATTTGATGC AAATCGGTAT 780
GCTTTTTTGG TAAACTGCAT CATGCGGTGA AGCTTAAAAA CTGTAGAAGT GAATGCGAAC 840
ATGCCAACAT GGCTGCCCGT GCCCCTTTAA ATCAAATTGG CCAGATTGCA TTTCCATCGT 900
GGAAGAGGTG TGATGAAAAC CACTGCTTTA TTGTTACCGA AAACATAAAT GCATGCAGCG 960
CTTGTTTTGT ATTCATCAAT AAATCATGAA ACGAAGCATG AGGAAAAGAG CGGTAGAATA 1020
AAAGCGTCTG TACCTTCAGC GTGTTCCATT CTAAACAAAT ACAGCAAATA AACTGGATCC 1080
CTGCTGCAGT TAACATAAAT ATATCAACAC AAAGACCTAT GA 1122