EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-02662 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr10:20420140-20421206 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXC2MA0846.1chr10:20420910-20420922AATGTAAACAAT+6.32
IRF4MA1419.1chr10:20421188-20421203AGTTTTCGGTTTCAG-6.16
IRF5MA1420.1chr10:20421189-20421203GTTTTCGGTTTCAG-6.09
POU4F3MA0791.1chr10:20421009-20421025CTTATTAATTATTAAG-6.17
Enhancer Sequence
TTAATTAAAA GTGAAATTTC ATGTATTGCA AACTTATTCT ATAACTATAT ACAATATATA 60
CAGTATGTAC ATACGTGCCC ATAATCTTCC ATCTGGCACT AGGATGGCTC AGTGCCTGGG 120
CCTCTTCCTC CGGGGCTCCT TGGGCAGCGG CTCCTTGCTG ATGTCCACCA TGATATGAGG 180
GGGGACACTG GACCCAGATC TGATCTCGCT GATGAACACA CGTCCATCAG CCTGCTCGGT 240
CTCCAACAGT GCAGGCCGGT CCAGCTTCTC CCACAGCCGC TGCTTTATCT TCAATCCGTA 300
CTGGAGAGTG TATCGACCTG TCCGCTTCTT CACGATGGAG TCCATCACAC TGCGGTAGAT 360
GTGCTGATAT TCCTGCACAC TCCAACCGTG GATGGAGATC GGCTCCTCCT GTAGACACTC 420
ACCCACTGAG GAGATTGAAG CTGCGGGACA GAGGACAGGA AGGACAGCTC TGTTCTTCAG 480
GTGTCGCTGC TCCACGGAAG TGTCCGACAT GCAGCTGTTA GTGTCAGGCC CGGCCGCCGC 540
TGCGTGCTCC TCAACAGAAG AGACGCGATC CAGCAAGAAG TCCTTGAGGT GTCTGGGGAG 600
AGTCCTGGTC CTACTCGAGC GTCGCAGAGT CATCATGAAC AACTTCCCAA ACTGATGATA 660
GTCAGCCAAC AGGAAAATAG TTCAGAGTTG ATTGATGACT TTATAGACAG TTGTGTGGGT 720
TTGTAAACCA ATTCAGGTTG CCGTGGTGAC AGAATGACGA GTTTTAGTTA AATGTAAACA 780
ATAATTGATT ACAGCGTTAA GTCATTTACA GCAGCACGAA CAGTATACAG TACATATTTT 840
TGGTAAATGT TATTTAAAAC AGAAAATATC TTATTAATTA TTAAGTATAA TAACAGAGGG 900
CCAATATAGC CTACCTAAAC AAATATTGTC CCCATTTTCC GTTTATTTCC ACGTCAGAAA 960
TCCGGGGCCT GTTTCAGTAA GGAGGTTCAA ACAACTCAGA GTTCAAACTT GAACTCTGAG 1020
TTGATTTACC GAGAGATTAA AAACTCTGAG TTTTCGGTTT CAGAAC 1066