EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-02592 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr10:17492010-17492688 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Lhx3MA0135.1chr10:17492371-17492384TAATAATTAATTT-6.25
SOX21MA0866.1chr10:17492581-17492596AACAATACCATTATT-6.34
Sox1MA0870.1chr10:17492581-17492596AACAATACCATTATT+6.12
Enhancer Sequence
AAATGATTTA TTTGTGCTTT CTAAAAGAGT TAAAATGATT AAAAAAAACA TTTCCATCAA 60
CCTTCATAAT AACAAATACA ATCATGCATT TTGTAAGCTC TTTCAGAGTT GCATATGAAA 120
ATAAACTCTT TGTTTAATTG TTTTGATTAA TGTAGAAATG TTCATTTTTC TTGGTGAAAT 180
TATTTAAAAA GGAGCAACCA TTGAAATTTT CTGTGCATGT TTTTTAACCC TTGAACAGCG 240
TGACATGATA ACCTTACAAC CTTTAAACAA AATACACCTA CAGAACATGA ATTCAAATGA 300
TTTACAGAAC TCCGCGTATA CGACTTTTAA AAGCATGTAA GACTAGCCGA AAAGCCGCTG 360
ATAATAATTA ATTTTTAACA TGAACACGAT TAGCAAATGG TGGATCTGGA GTTAGTTACA 420
AGCGAAAGAC CGAGTCAGGA CGTCCCTGCT AGTTTCACCC GCAGCCTGTT GAATGCATTG 480
GCCACATCAA ACACTTTTAA GCGCACAATC AGATCCCTTC AGATTGGGGG ACAGAGAGAG 540
GGAAGGGAGG GAAATGGGCC CTTTCTCACC AAACAATACC ATTATTTCAG CTCCCTTGGC 600
CAAGAATGCC ACATTTCACA GCCCACTACC CTCCTCCAGA TGTCAATCAA AGCTCACTGG 660
CCACTCAGGC TCCGCCTA 678