EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-02194 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr10:6008900-6009850 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr10:6008924-6008934TTTAATTAGA-6.02
ARGFXMA1463.1chr10:6008924-6008934TTTAATTAGA-6.02
FOXB1MA0845.1chr10:6009667-6009678TATGTAAACAT+6.14
FOXC1MA0032.2chr10:6009667-6009678TATGTAAACAT+6.32
FOXC2MA0846.1chr10:6009667-6009679TATGTAAACATA+6.14
NFYAMA0060.3chr10:6009153-6009164TCTGATTGGCT-6.32
RFX1MA0509.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.86
RFX1MA0509.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.86
RFX2MA0600.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.32
RFX2MA0600.2chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.37
RFX3MA0798.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.17
RFX3MA0798.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.26
RFX4MA0799.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG+6.53
RFX4MA0799.1chr10:6009125-6009141TGTAGTCATGGTAACG-6.56
Enhancer Sequence
TAAATTCAGT ATTTAAATCT CATATTTAAT TAGAAAATGT GGCAACGAAC TGCAAAACGG 60
TATTGTTTTT TAAGTAAAAA AGAATTACCC CTTACAGCAG GCTGGTAAAT GGTTATAAAT 120
ATTACTTTGA AAGCCTGTAA GACACACTGT GTGCTTTACA TGAGGCGCTG ACAGAAGTTC 180
AGCGCGCAGA GATGAGCTGA TCCTCCGATA TGATGTGTGT GTTCTTGTAG TCATGGTAAC 240
GCCGTTCGCG CGCTCTGATT GGCTGCTGCT CTCTCAGACA CGCGCTGTGA TTGGCTGCTC 300
TTCTCTCACC ATACACCGTC ACTCACTCAC ACCATTGAAC CACTTTGCGC ACCTCGTCCA 360
TTGACCCTCC TTTTTTGAGC GCTGATTGGT TGAGAACCAG AGGAGGGCGG GAAAATGAGG 420
ACCTTCAGAA CTGCTTCTGT GTTTTGATTG GCCGCCTGAA AAGCGCTCAA GAAACTGAAG 480
CTCGCCCTGC ACAGGTATCG TCCGCTTGTA ATGTATAAAT AGTATGTCTG TATTACCGCT 540
TCACTTAATG ACAAGCGACG GTTAGCACCT CAGGAACTGA AGTCTGCAGG TAAGTCTGAG 600
TTAACTTTAA CATTAGACAT TTTATAGAGA TTTACAGCTG AACTGCATTT ATTTCATCCA 660
AATAACTGAA GTAATTTCCT CTTTAGTATG TAAAGAGTGT TACTTAATAT TTTAAAAAGG 720
CTTTATGTTT ATTAGTGACC AAATCTCTCA TATATTTTAC AATAATATAT GTAAACATAC 780
AAAACACCTG GATCAACTTT GTGAAAGTAC CTAGGAGTAA GTCACAGACT TTAAATGAAA 840
CTTTCATTTT GTTGAAGAAA CAAGATCTGT CGTTGGCCTC AATCTCCAAC TCAATCTCAT 900
TTACCATCAA AGTAGTCAAT ACAGTTGTTA TACACTACCG GTCAATAGCA 950