EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01884 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:56656150-56657080 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
CDX2MA0465.1chr1:56656492-56656503TTTTATTGCTT-6.32
E2F7MA0758.1chr1:56657017-56657031TTTTGCCGGGAAAA-6.62
Hmx2MA0897.1chr1:56656488-56656505ATGCTTTTATTGCTTGT-6.4
Hmx3MA0898.1chr1:56656488-56656505ATGCTTTTATTGCTTGT-6.09
NFAT5MA0606.1chr1:56656583-56656593ATTTTCCATT+6.02
NFATC1MA0624.1chr1:56656583-56656593ATTTTCCATT+6.02
NFATC3MA0625.1chr1:56656583-56656593ATTTTCCATT+6.02
SP1MA0079.4chr1:56656268-56656283TGTGGGCGTGGCTGT-6.05
SP1MA0079.4chr1:56656204-56656219TATGGGCGTGGTTTT-6.2
SP3MA0746.2chr1:56656268-56656281TGTGGGCGTGGCT-6.37
SP8MA0747.1chr1:56656268-56656280TGTGGGCGTGGC-6.22
Enhancer Sequence
TTTTAATTAT GGATTTATGC ACAAATAAGG CTGTTTCATG ATCCCAGGAG CTGCTATGGG 60
CGTGGTTTTT ACGCGTGTGT TGTTATAGTA GGCGTGGTTT AGTTGCGTGT CGTGTGTTTG 120
TGGGCGTGGC TGTGACTGCG GTTGTATGAG GTGAAAGTTT GAGCCGGACT GTGTGTGTGT 180
ATGTGTGTGT GTGTGGATTC TGACTCTCAC ACGCGGTAAT GAGCGGTTCA TTCTGGACTG 240
AAACACTCAT TTCTGCTCGC GGTTCGGTCA TGTAGGTGTT GAAGATTGCA GAACTGGGCA 300
TTTCTACAGG CTGGAGGAGC TTGACGGGGG TTTGGAGGAT GCTTTTATTG CTTGTGTTGT 360
CAGCTGTGGT CCTGTGTGGA TGTGCACAGT ATTCCAGTGA TCAGTGCAGC TGGACGGGAA 420
GGTGAGGATT ATTATTTTCC ATTAGTGTAA AGATTTTGTT GATTTAAATG CGTTTTTAAA 480
AACAGCTTTT ATTCTGTGCT GATGTATTGC ATACATAAGG ACAATAACTA AACTCCGTTT 540
GCGTTGTAGT TTGCATAGAA TGTTGCACAA CAATTTTTAT AGATTTTCTA AAATCATTAC 600
ATTTTATTAT CTAAGCTCAT CTTGAACATT TTAGTCAGCT TTGTCTGTTT TTTGTATTAA 660
TATTGGCATG CAAATAAATG AGATTTAACG TTTGAGGACT GTGATACTTA TTTAAACGTG 720
TTATAATAAT ATTTAAAGAC TGTTAAAGCA AGAAATGCTG TGAGAGAGGA TGGTCTGGAC 780
ATGCCCTTAC TTAGGACATG TGCTGACATT TAACCTGAAG ACACTGAATC TCGAACCGAT 840
TCTTCTGAAG CGATTCTTTT CCATGCGTTT TGCCGGGAAA AACTGTTTTG GTGAATGAAT 900
TAGTATTCAA CTGTACACTA ATTGTGACAA 930