EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01833 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:54312516-54313706 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Nkx3-2MA0122.3chr1:54312527-54312540ACAACCACTTAAC+6.02
POU1F1MA0784.1chr1:54312694-54312708TTAATTTGCATATG-6.38
POU2F1MA0785.1chr1:54312696-54312708AATTTGCATATG-6.07
POU2F2MA0507.1chr1:54312694-54312707TTAATTTGCATAT+7.34
POU3F1MA0786.1chr1:54312695-54312707TAATTTGCATAT-6.74
POU3F2MA0787.1chr1:54312695-54312707TAATTTGCATAT-6.74
POU5F1MA1115.1chr1:54312696-54312707AATTTGCATAT-6.62
Pou2f3MA0627.1chr1:54313221-54313237TGGTATGCAAATGACC+6.37
Pou2f3MA0627.1chr1:54312693-54312709ATTAATTTGCATATGA-6.48
RREB1MA0073.1chr1:54313304-54313324TGTGTGTTGTTGTGTTGTGT-6.47
ZNF384MA1125.1chr1:54312581-54312593TTTTTTTTTAGT-6.32
Enhancer Sequence
ATAAATTGTT TACAACCACT TAACCTAAAA AAAATTGAGT AAATCCAAGG AATCATCTCT 60
AAATATTTTT TTTTAGTGCA GCATTCTTCA ATATATGTTG TCTTGTGTTC AACAAGAAGA 120
GGATGAGTAA ATGATGCCGC GCTTTTCATT TTTGAGTGAA CTATCCCTTT ATTTACTATT 180
AATTTGCATA TGAAGAGTTG TGATTTGCTA GTGTCTTGCT CTACTACTAG AGATACAGGA 240
AATACAACAG TGCAGCAGAC CATGTTAGTG CACACGAATC CACATCAGTA GACAAACTGC 300
TTAAATAACA CGTTCAATTA TTTTTAAAGT GGCATTTTAT GAGAGCACTG TGCTAATAAA 360
CCTGCATCTG GGCATTAACA CTGCATCTAA CAGCACTAAA GCAGACACAT GGAGGTGTCA 420
CCGCATGCTT TTTTAGGGTG TCGTCTCACA ATATAGACTT TTTTAAATTC CCAGAGCCGC 480
ATGTCTGAAC GTGTTTGCAT GCTCTGTGCA AACGTGGAGG ATTACAGGCA TTTATCTGCA 540
AGCCTCTGGG GTTTACAATC AGCTAAATTG CACTTACTTT TAATTTCATA AGAATAAACT 600
TAGTTAAAGT GACCAACGTA ATACACCAAT ATAGAGGCTG CTGCCACTTT AAATGCACAC 660
TTGTAAATGA ATTCCAATGT TTAATGCAAG CCACACCACA ATCCTTGGTA TGCAAATGAC 720
CCTCTAATAG CAGAAATGCC AGTAATTTCA GCATTTTAAC TGCTTTGGCC TGTTCTGTGA 780
GTATGCTGTG TGTGTTGTTG TGTTGTGTTT ATTTATACGA GCCAGCAGTC AGATGGTATT 840
TACTCTCACA TGGGTCGACT CTGACCTTTA GCACGCACTC TACACAGCCT ATGTGTGAAA 900
CGCAATACTT TCTTCCCAAC GACATTCATC ATAATGCAAA AAATGCATGC AGACACATGC 960
TGGCATCATA TCTGGCATCC AAAACTAGTG AACAATCATG TGCAAAATAT CAGCATGACA 1020
TACGATTGTC CCATGCATAC AGGCCAACTG AATAATCACT TGCGCTGAGG TGTAAAACAC 1080
AGTGTTAAAG CACAGGATGT GTGTGTGTGT ATAAACAGCA TGCCTCATGC CGTGGACAGA 1140
ATAACTCTGT GTCGTTTAAA GACTGTGTGT CTGTTTGATC ACGTCTTCTT 1190