EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01826 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:54230391-54231959 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXB1MA0845.1chr1:54231056-54231067ATATTTACATT-6.32
Foxj3MA0851.1chr1:54230873-54230890TAAATATAAACAAAAGC+6.36
Foxq1MA0040.1chr1:54230756-54230767AATAAACAATT-6.02
Hmx2MA0897.1chr1:54230980-54230997ATCTATTAATTGTTTTT-6.89
Hmx3MA0898.1chr1:54230980-54230997ATCTATTAATTGTTTTT-6.46
KLF16MA0741.1chr1:54231442-54231453GCCCCGCCCCC+6.02
KLF5MA0599.1chr1:54231442-54231452GCCCCGCCCC+6.02
MNX1MA0707.1chr1:54231910-54231920GGTAATTAAA+6.02
RESTMA0138.2chr1:54231498-54231519TTCAGCACCCGGGACAGGCGT+6.58
RFX1MA0509.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.34
RFX1MA0509.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.35
RFX2MA0600.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.44
RFX2MA0600.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.52
RFX3MA0798.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.42
RFX3MA0798.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.49
RFX4MA0799.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC-6.17
RFX4MA0799.1chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.72
RFX5MA0510.2chr1:54231235-54231251TGTTGCTATGGTTACC+6.11
SP4MA0685.1chr1:54231439-54231456CCGGCCCCGCCCCCTCT+6.34
Enhancer Sequence
TTCAGATTTT TTGAGGGAAC ATATCCTGAG TGAGTTTCTG ACCGTTTGCT TCGTCAAAAT 60
CAACTGCTAC ACTAATACAC AATATAAATA TCTGTCAGGA ATTTTTGCAC CACATTCACT 120
TAATAACACT CTTGTCAACT GAACAACTTG GCGCCACTCA CACTGTTGGC TAACCGCCGT 180
TTACATTTAA AGATAAAACG CTGCACAATC CCTCAGTCAG GGTTGTAGAA AGAATACAGC 240
TGCGGCCAAA AAATAAAAAT TATTCAAACA TATTCATATT TCATTTTAAT GGTATTCAAA 300
CGTAAAGGCA GATTTATTGG GGGAATACAT GCTGAGTGAA ACTCAGCACA ATCTACTGTT 360
ACATTAATAA ACAATTTGAA TATGGATGTG TGGAATTTCT GTGAGGAATT TTCTCGCCAC 420
ATTCATTTAA TAACCGTCTT GTTAACTGAA CTGTTTTGAC GCCTTTCGCA CTGTTGGCTA 480
TTTAAATATA AACAAAAGCC CCACAATCCC TCACAGTCTG GGTTGTTGTT AAAAGGGATA 540
GAGCTGCGGC CAGAAATGTA TGAAAATTGT TCTTATTATT TATTAAATTA TCTATTAATT 600
GTTTTTTGAA CGTCTACCCC AACCCTAAAC CCAAAATCAA AGTAATGTAA AAACAAAACA 660
GAGGAATATT TACATTATTT GTTAAATTAG CTATTCAGTT GTATTTTATT GACGTCCACC 720
TCCACCCAAA TTCTAAATCC AAGCCTTACA GTAAAGTAAA ACTATTAATT ATTGCTGTAC 780
AGTGTCACTA AAACATGTAT GTAAAGCTGT ATGCCATCTA GACTTTACCC TCAATCTGAC 840
TTACTGTTGC TATGGTTACC TTCTCAGCTG AACACAGCTT CTCTCCCTGA GCGTCCACTA 900
CTGAGCTTTG ACTCGTCTGT ATTATAATAC TTGTGCTTTA AAAACATAAA TCCTCATCAC 960
AACATTACTT CACATGACTG AAGCCGTTGG AATCTGCGCG GCTTCGGTTA CCCCTCCCCC 1020
CGCGCGTCAG AACATTGTGT GATTGTTTCC GGCCCCGCCC CCTCTCCGTT TATCCCCACG 1080
TCCAAACGTT TATTCCCGTG AACCCGTTTC AGCACCCGGG ACAGGCGTCG CGTGCTCGCA 1140
TGGCAACATG GCCACAGAGG TGAGCAACAC CCTTTATCCA TTAATGCTTT TCTGCACCCG 1200
CTGTGCTTAA AGACTTGTTT TGTAGGACAC CAGTCCGTGT AATCGGTGTC GTTATTTAAA 1260
TCAGGGCTGG AGATCACGGA TCAGTTCGTG ACGTTACAGA CAAACTGTCC GTTTTCACGC 1320
GTCGTTTTTA AATCCGACAG AGATACTGCT AAACCAATAA CACAGAATAA ACTAAACATA 1380
CAACACACAG TGTAAGCTAC ATGCTAGTCA TGAGCAGCTA CAAGTTAAAC GATTATAAAC 1440
ACAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG ATAGATAGAT AGATAGATAG 1500
ATAGATAGAT AGGCAAGGCG GTAATTAAAT TTTTATTTGA GTCGAAGTGA CTTAAAATCA 1560
AACCGACT 1568