EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01820 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:54088223-54089217 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BHLHE41MA0636.1chr1:54089196-54089206GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:54089196-54089206GTCACGTGAC-6.02
CTCFMA0139.1chr1:54088479-54088498CGGTGACACCTAGTGGTCA-6.85
MITFMA0620.2chr1:54089192-54089210TTTAGTCACGTGACCAAG+6.97
MITFMA0620.2chr1:54089192-54089210TTTAGTCACGTGACCAAG-6.97
USF1MA0093.2chr1:54089196-54089207GTCACGTGACC+6.14
USF2MA0526.2chr1:54089192-54089208TTTAGTCACGTGACCA+6.02
USF2MA0526.2chr1:54089194-54089210TAGTCACGTGACCAAG-6.65
Enhancer Sequence
GCCACTTTAA TAGGTACACT TTACTTGGTA AGTATATTAT AAATATTTAT AAGCGATCAT 60
GCCTGAGGGT ATTGGACGGA ATAACACAAG CAGCTCTAGA TAAAAATACT TTTCACCCGG 120
AAGAAAGCGG AAAAATGAAC GCCCGCCATC CATCCCCCTG CCTTCCCTCT AGTGGTGGGC 180
AAAGCGAGGC TTCGTGAAAC ACTGAAAATC GAAGCAAATG AGTCGAAGTT TCGAAACGTT 240
TCAAAATCCG ACTCTACGGT GACACCTAGT GGTCATTTTT TCATGTATTG CACCGAAACA 300
GCTTCAGCAA GAACATTTTA GCAAATTGAG GTATTAAACC CTACTGTGTA GAAGTATATA 360
TTCAAGAGTT TTAGTGGAGC AGTTAAGGTT TCTGACTTTC ATGTGTGGAT AGTGGGTTTG 420
AATCCAGGCT GATACAGCTA TTTTGAAATG CTTTAATACC AGTTGGTAAT TCTTTGTTCT 480
TGTTTCGTTT TGTTTGAACA TGGTCTGACA TCCGAATAAA CACTTTGTAA ATAAATGTCT 540
TGTTTTGGTA TTAAAACGGT TGTTGCTAGA TCAGACACAG TTGTGGCCAG AAGGTATCAA 600
GAATTAGTTA TATTATTCAT TAAATTTCCC ATTTATTGTA TTTCATTAAC GTCTACCCAA 660
ACCCTAAACC CAACCATCAG TACTGTTAAA ATATTTATTA TTGTTTTAGT GTTACAAAAA 720
GGATGCTATA TTAATGGCGT ATCCGCAGCT GTAATCTATT TAGGCTGCAC CATAAAACAG 780
AAATATGATT AAAATACATA AAACCATGAT TTGGCAGTAT TTGTACAAGT CGAGGTTCGA 840
ACCCAAAAGA CATTAAAGGA ACTGTAAAAG CGTACTCACG CACAGTCCAC TTGACCATAT 900
GAGACGGCAG TATTGTTTAG ATTCGCCCGG TGTCAAAACG CTTCTTAACT GATCGATGCT 960
TTGAATCACT TTAGTCACGT GACCAAGTGT TTCG 994