EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01819 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:54086805-54087839 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
BCL6MA0463.2chr1:54087436-54087452CTGCTCTCTAGGAAAA+6.41
BHLHE41MA0636.1chr1:54087240-54087250GTCACGTGAC+6.02
BHLHE41MA0636.1chr1:54087240-54087250GTCACGTGAC-6.02
FOXC2MA0846.1chr1:54087139-54087151TTTGTTTATTTA-6.18
FOXD2MA0847.2chr1:54087140-54087153TTGTTTATTTAGC-6.12
FOXE1MA1487.1chr1:54087139-54087154TTTGTTTATTTAGCT-6.16
Myod1MA0499.1chr1:54087278-54087291AGTGACAGCTGCC-6.04
NFYAMA0060.3chr1:54087678-54087689GACCAATCAGA+6.14
POU2F2MA0507.1chr1:54087525-54087538GTCATTTGCATGT+6.08
Enhancer Sequence
TGTTGTATTT ACAGAAAATG TTAAAAGTAT GAGTATGCTA TTAACATAAG TGGTTTACAT 60
AAGGCGGTAT TACTCAGTGA TAATCACGAA TGACTGGTTA GCTTAGCTTG CTAACACTTG 120
CTATTAACAG TAATCAACGT AATCGCGGTT TGTTGATGCA TAATGATGGC AGTACGTCAA 180
CTGACGTCAA TTAAAAGAAA AAATTAATAA CGTACATCTA ATTTAAAAAT AATAAAAAGC 240
GTAATTATAA AAGTAAACAT TGTTTGCCAA CACTGGTTTT GTTTTAAAAT TCCAAAATAA 300
CGCAACTAAT AGAGAACTAA CTTCTGGCAA ATGGTTTGTT TATTTAGCTT CCGTAAATAT 360
CTGTTTTTAC TTCCAAAAAT CATCTTTTCA TGACTGAATT TGTCACAAAG CCTACAGAAG 420
TTTGCAGCAC AATGAGTCAC GTGACGACGT GACAGTGACG CACGAACATC CGCAGTGACA 480
GCTGCCTGCG CGAGGACACT GCAAAAAAAC AGCTCTTTCA CACATATCTA CTGAAATTAG 540
AGCAAATGAG CGTAGATTTA AAGCATTTCG ATAATGAAAA TGCTCGGGTA TGAACGACTC 600
GTTTATAGCA TTTACATTCG GTTCCGCTTT GCTGCTCTCT AGGAAAACAA ATGAAAAAAC 660
AACAACGACA CAATTATGCA AAGGTCTACC CACCTTTTCT GTCTGAACTA CTGTCTTTGT 720
GTCATTTGCA TGTTAGATCG TCGGAGTTTC TCTCGGTAAA GCGGTGTAAT AGTGTAGTAA 780
ACAGGCTGGC TGCTGTCTCC GTCTGGGTAC AGCGAGCGAA ATGGACAGAG AAGTTCAACC 840
CTCTCTAGAC TCGTCACCTA CTGTACCCGC TCTGACCAAT CAGAAGGCAG GAATGAACGA 900
TTGAGCCCGC CTCCGATTCT CTTTCAGCCA ATCACATCAC TGCTTTATGT GCGTCTTGTA 960
GTGTGCATTG TACAGTGTGT GTGTGCGTGT GTGTGGTGTG GTGTGAAACT GAGAAATGTG 1020
TAATCCTTCA TTGA 1034