EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01802 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53504945-53506365 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxj3MA0851.1chr1:53505447-53505464TGACTGTAAACAAACTC-6.14
POU3F3MA0788.1chr1:53506030-53506043TTTATGTAAATTT-6.07
SOX10MA0442.2chr1:53505791-53505802AAAACAAAGGA-6.32
SPICMA0687.1chr1:53505049-53505063TTCTTCCTCTTTTC+6.47
Sox3MA0514.1chr1:53505791-53505801AAAACAAAGG+6.02
Enhancer Sequence
AGCACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACATT 60
GTTGATCCTC GTGCCACTAG CGTTTCTCTC AAAGTCCTCG TGGTTTCTTC CTCTTTTCTG 120
TTTAATTTCA GCCCTCCAGG GTTTCACTTT AACAACACCT ACACTCGCAC AGTGTACACA 180
GGACACTAAT GCACACCCCA CAAACACACA CACACACACA CACACACACA CACACACACT 240
CTCTCTATCA GGCCTCTCCA CCACAACACA CACCACACAG ACAAACTCTG GTTAAAACAT 300
GAACAACTCT GACATACCTA GTTTAACTTA GGTCTACATT CTTCTCAGTA TATAATGCAA 360
ATTTAGAATT GTGTGTAAAA AAACAAAAGT CATCTCACAC ACACACACAC ACACACACAC 420
ACGCAAACAT GTCCACACTG AGTTCCTGAT GCTATTTGAA TAAATTCTGT TACTCATTTC 480
TGGTAAGGGT ATATGGTTAA CGTGACTGTA AACAAACTCT GATGCGTTAA ACCCAAACTT 540
CCTGTCACTG CATGTCTGTT TCCTGTGTGT GGGTTATTAG CGTGTGAGGT TGTGCAGTGA 600
GATGTTTGCT GCTGTCACAC ATACACACAC ACACATAGAC AGGGAGAGTG AAACAGCTGT 660
GTCATTATAT AAAATACAGT TTAAACACAA ACAGTCTGTG ATCAACATGT GACGGCTGAT 720
TTTATTCAGA AAGGTAAGAC TATAATTTTA ATCATTAGTA TTATTAATTC TTGTGAAAAC 780
AGCATGTTTT TCTGATTGTT TGAGGTCCTT TAAAGATCAT GTCAAATTTT TATCTTTACA 840
TACAATAAAA CAAAGGAGTA AACATTACTG TTTCCACACG TTTCTTTCTA TTTTGTCATT 900
TTTTATCTTT ACATACAATA AAATAGAAAA GTAAACATTC CTGTTTCCAC ACACACACAC 960
ACACACACAC ACACACACAC TTGTAAAAGA AAAACAACAA CAACTTATTT TAGGGTTTAT 1020
TTCCGGCAGC TGTGTTAAAT TATAGAAATT TACCGTAAAA AAAAATGACA TTTTTAAATT 1080
TAAATTTTAT GTAAATTTCT TTAATTAAAC CTCTGTTATT TTACAGTAAA TTTCTGTAAT 1140
TTAGCAGCCA TTATTTTACG TTTTTTTCCG GCACCCCAGC TGCCGGAAAT AAACTCTAAG 1200
ATTAGATTTT TTTGTTACAG TGCACGTTTC CTTCTATTTA ATTTTTTTTC AGAATTGTGA 1260
AGAGTCATTT TAACTTTTTC AGCTGCGTGT GGGCCACACA TTTCCGCCAC TATTTTAATG 1320
CAGGAGGGTT TGATTAGCTC CTCTCCAATA TTATGCAGCT TTTTTCCCGT GGCAATCCAC 1380
ACCGAATAGT CAAACAAAGC TTCAAAAAAA ATCTTTTTGA 1420