EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01796 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53479148-53480942 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MAFFMA0495.3chr1:53480023-53480038CTGCAGACTCAGCAT-6.28
MAFFMA0495.3chr1:53480023-53480038CTGCAGACTCAGCAT+6.36
NFAT5MA0606.1chr1:53479974-53479984ATTTTCCATT-6.02
NFATC1MA0624.1chr1:53479974-53479984ATTTTCCATT-6.02
NFATC3MA0625.1chr1:53479974-53479984ATTTTCCATT-6.02
RFX1MA0509.2chr1:53480563-53480579TGTAACCATGGTTACA+6.16
RFX1MA0509.2chr1:53480563-53480579TGTAACCATGGTTACA-6.16
RFX4MA0799.1chr1:53480563-53480579TGTAACCATGGTTACA+6.42
RFX4MA0799.1chr1:53480563-53480579TGTAACCATGGTTACA-6.42
Enhancer Sequence
CAAAGCCAAG ATTGAGTTGG TTGTTATCAA CACTAGAGGG CAGAACGGCC GAAAAAAAAA 60
AGAGTAATTA CTTCACACAT CAAATCTGTG TTTACACCTA CACTCCATCA CAGTTACACA 120
AGTAAATATG AGAAGAGCAA AATCAATTTT CTAGCTGAAT GTTTTATGGT AGTGTTGCAG 180
ATCTGCAAGT GAGAGTGTGG GCGAGTTTTA AATGCAGTGG GCGAATAAGC CTTGCACAGC 240
AGCTGATGGT CCCTCCAGGT CAGTTACAAG TCTGTTATTC ACTCAGTGTG AGCAACATGA 300
GCTGATCCCA GATCTGTCCA TAAAGCACGC GAAGAGGAAG AGTTCCGCAT GGATATCTGT 360
GGCTCTGACT TATCCAACAT CTGATCTCTC CAATCCTCTC TCTCTTTCAC ACACACACAC 420
ACACACACTT TTCTGTCGTT CTCACCATCC ACCTGTTTCG CACTCAAACT GATGAGTTCC 480
AGGCTCAGAC ATTTACTCAG AAACGCATTA CTCTGGATCA AGAAAACGCA TTATTTTATC 540
AATGTGAACG CTTGAGGGAT GCGTGACTGA AACCCTTCTG GAGGAACGTC GGCTGATAAA 600
CTTATTGGAC TGTTAATGGG ATGAGGAGAG TCATTTTCTG GACGACGGAC GACACACTCG 660
AGTAAACCAT CAGTTCTTTC ATTACAATTT GAAGCAAACC TCTTTTTAAA AAGCAGGATT 720
ATTTGAACGC GTTTATTACG GTTGAATTAA TGCCGTTATT TCGATTTTTC AAAACAAATT 780
AAATTTTTAA TTTCGATGTT CAGTTAAAGG ACCGTTTGAA CGTTACATTT TCCATTTTAT 840
AGTCATTTTC TCAATATTAA ATGACTAAGA AGCGACTGCA GACTCAGCAT GTGGAATGAA 900
GCGTTCTTTA AAACGTGAAT AAAACTATTA TATACTATAT TTGAGTTGTT ATTGAACATG 960
GCGAACACAC TGGAGAGGGA GATTCTGGAG CGGGAGCTGC GTCCGCGGCT GTGCTATCTA 1020
ACGAAAGGAG ATCGCGGTTA CGGATTTCAT CTTCACGGTG AACGGAACCC GAGGAGCACA 1080
ATACATCCGC AAGATCGAGC CGGGCTCCCC CGCTGACCTG TCCGGCCTGA GGTCTGGCGA 1140
CCGGGTGGTG GAGGTGAACG GAGAAAACGT GGAGGGAGAG ACCCATCACC AGGTAAGCGG 1200
AGAGGAGAAC CTGTTGGACC ACTTCACCTG CTGCAGGGAC GCGTCACAAA CCCTAGCGAG 1260
CTGCCTAACA AGACAACATT TTTGTCCATT ATACTGTATG ATTCATTTAA ACTTTCCAAG 1320
TCTTCTGATC CAGATAGGGC ACCTAAAAAT GAAAATTTTC ATTTCACGTT TTGGACTCAT 1380
TCCAAACGTT TTTTTTTCTG AAAACTTGTA GCCATTGTAA CCATGGTTAC AGGTTTCATC 1440
TGTTTTCAAA ATATATCTTC TTTTAAGATC AACAAATTAA AGTCAAACAG CTTTGGAACA 1500
AGTGAAGGGC TAAAATTGTG ACTGAAATTT CATTTTTGGT GTGAACTATC CCTTTAAATG 1560
TGTGTTTCTC ACGCAGGCAT GATACCCACT ATGCTGTCTA GATAGGAATC TGACTATGTT 1620
TTGAGCCACA GCCTCAGAGT CAGCAAGTGT GCTGTATTCT ACGGAGGTGA CAATGTTAAT 1680
GTATATTTGT TCAAGATTGT ATCCTTGTGT GCTGATGTTA AGAAAACACT GCAGTCTCGG 1740
CTGCAACGAA ACTTCCCCTC CACCCTTACA AACATTTACC ATGGTAACTA TAGT 1794