EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01788 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53345886-53347578 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Alx4MA0853.1chr1:53347390-53347407ACTTGTTAATTAATGGG-6.55
GRHL2MA1105.1chr1:53346175-53346190TCAAACTGGTTTGGG-6.27
Nkx3-2MA0122.3chr1:53346005-53346018AAATCCACTTAAA+6.39
ZNF384MA1125.1chr1:53347471-53347483TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:53347470-53347482TTTAAAAAAAAA+7.22
Enhancer Sequence
CTCCACTCGC TTTGACATGA TCCAATGCTG TCGTTTTAAG TGTGTTTAAA GTATAGAAAT 60
GTTAAAACTA CTTATTTAAG AAGGAGCTTT TTAAATGGAC AACTTAATTA TTTGTTGTTA 120
AATCCACTTA AATGTGTTAA ACAATTAACT TAACTTAATC CATTTGTGTT GGGACAGCTT 180
TAAGAAACTG TGTAGAATTA AGCATTTCTA CAGTAGTGTG AAAAGTAATG GAAGTCAATG 240
TTTACAGGTA TCCAGCTTCC TTCAAAATAT GTTCAACATA AGAGCATCAT CAAACTGGTT 300
TGGGACAAGT GAGCAGGCTA AATGATGACA GTTTTGGGCG AACTATCCCT TTAAGCAGAT 360
GTTTAAAATC GCCTTAAATG TAAGGGTATA AATCGAACTC AGGAGGATGC GCGCGCAGCC 420
TCATCTTTCT CTCTCTCCTT GCTCTATCAC CTTCTTCAAT CTACTGCCAC GTTTTTGGTA 480
AGACACACCG TGGCGTATCA AATCAGATTC CCCAGCCCCA TCGCCGATCG ATAGGTCGCA 540
AACAACATTA TAGCCCCTAA TTGTGATCCC CACACGACTT CATATGATCG ATCCCGTGTG 600
ATGCGAGCCC AGCTTAGGTT CCCACGGCCG CCCATGTGCT GTCTAACTCC GCTGGGACTG 660
CAACACTTCT GGCTTCGCCT GCGCCATCTG GCCCCTGCCG GCCCATACCG TTACAGGTTC 720
TTTAACATGC TTCTAGTTCA ATTTAGACGA AGGGCAGTGA GCACACACAC ACACACACAC 780
ACTCGGGCAG AGGGAGGGAG GAGACAGGCG TTTAGTCAGT GGCAGATGGT GTGTAAGGGT 840
CTGGTCGCGT CTGAAGGCGT ACCGTAGACC CCCTTCAGTG AGTGTCCCCC GAGGGGCTTC 900
ACAATCAATG AAAAACGAAA GCGCAAAGAA AGGCAAGAAG AAGCGAGCGA GTCCCACTGA 960
CGTGATATAG CTGAGGGGCT TAAGTTACTG CAGGAGTTTA CTACTGCTAC AGTCCACTGG 1020
GAGAGTGAAT GAAGATGCAA AAACTATTGG ACTGCACTCA TTTTGGCTCT ATGCACTGTA 1080
ATCTTGATTT AAAAAGGCGG GATACTGCAA CCTGGGACTT GTTTAAAGGG ATAGTTCACC 1140
CACAAATGCA TTTACTCACT CCTTACTCGG TCCAAACCTG TATGAGTTCC TTTCTTCTTT 1200
TTAAAAATAC AATTATGTCA CATGGAAACC TGTAACCATT GACTTCCATG TTTTGTTTTT 1260
TTATACTATG GAAGTGAATG GTTACAGGTT TTCAACATTC TTCAAAATAT CCTCTTTAGT 1320
GTTTACTAGA AGAAAGAAAC AGATAAAGTT GTGATAAAGA CTAATAATTT GGCTTGAGTT 1380
ATTCTGCAGA CTACTGGGAG AGTGAATGAA GCTGCAAAAA CTACTGGACT AGACTCATTT 1440
TGGTCCTTGT TGGCTATAAA CTGTTGCACT GTACAAGTTC AAAAAGAGCA GGATAGCTAC 1500
TGCAACTTGT TAATTAATGG GACAGTTCAC CCAAAATGCA TTTACTCACT CACTTGTTCC 1560
AAACCTGTTT GAATTCATTC CTTCTTTAAA AAAAAAACAT TACTATCCAC ATATGAAAAC 1620
CTGTAACCAT TGACTTCCAT ATTGTTCTTT CCTACTATGG CAGTCAGTTT ACAGCATTCT 1680
TCAAAATATC TT 1692