EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01786 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53339715-53340944 
TF binding sites/motifs
Number: 10             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:53339777-53339788ATATTAATTAT+6.02
FOXD2MA0847.2chr1:53339828-53339841TTGTTTACATTAG-6.11
FOXK1MA0852.2chr1:53339825-53339839TGCTTGTTTACATT-7.34
FOXK2MA1103.1chr1:53339827-53339838CTTGTTTACAT-6.62
HNF1AMA0046.2chr1:53339976-53339991TGTAAATTATTAACA-6.21
HNF1AMA0046.2chr1:53339976-53339991TGTAAATTATTAACA+6.42
HNF1BMA0153.2chr1:53339977-53339990GTAAATTATTAAC-6.23
HNF1BMA0153.2chr1:53339977-53339990GTAAATTATTAAC+6.5
LMX1BMA0703.2chr1:53339894-53339905ATTTTAATTAA+6.62
Sox3MA0514.1chr1:53340679-53340689AAAACAAAGG-6.02
Enhancer Sequence
TCAAACCAGC AACCTTCTTG CTATAAGGTG ATATTGCTAA CCACTGAGCC ACCGTGCCAC 60
CCATATTAAT TATAGTTCAA CATTTACTAC TGCATTAAAG TCCAAATTCA TGCTTGTTTA 120
CATTAGTTAA TGCACAGCGA GTTAACTCAA ACTGACAATG AATGACTTTA TTTACACTTA 180
TTTTAATTAA TAAATGCTGT AATACATGTA TTGTTGATTA TTTGTTCATG TTAATAAATA 240
CATTAGCCAA TACAACCTCA TTGTAAATTA TTAACACAAT GATTACAATG ACATTTCTAT 300
CATATACCTC TTCAGAAAAC CATATTAGAC TTCCATCCTT ACTCTATTTG ATTTGTTTGC 360
TTTCAATTTG TTCATTATGT TTTTTCTACA TGATTACGTC GTCTACAATC AATCTAAAAT 420
GAATGATTTC TTTTTCAATA TAGAGGTATT CATCTGCTGA ATTTGTATTC ATATTCACAA 480
TACACAGTAT GTACGTTGCA GAAAAACCAA ATATCGCAAC GTCAGGCTTT TCCGATATCA 540
TGCAACACAC ATAAACACAC ACACACACCT GTGTTGGCGG CGTCATTTGG AAATGAGCAA 600
TCATCTCTCG CAACAGATTG TTTGGGCCAG TCTGGAGGAC AGTGCTCATG ACAAAGGCTC 660
ATAGAGAGAG CGTGTGTCCT CAGGGAGTGT GTAAGTGTGT GTGTGAGGGG GTGATGGAGG 720
TATAGTTTCT GCCCCTCCTC CTCTTTTACC CCTTTGTGGG CCCTTCTGAG GAGGATTGAG 780
GAGGTTAAAA GGGAGGAGAG CAGAAGAAAA GGATGATGGG GGATGTGTGA GCCCTAAACA 840
CAGGTGCCTA CATCTGTTCA TCCTCAGGGC AGATGCTGCT GGAGACACAC ACACATAGAG 900
AAAGAGAGAG AGAGAGGGAG AGAGAGAGAG ACAGAGAGGA CTAACTTTTA TGGGCTTCTT 960
TTTCAAAACA AAGGCCTGAA GTACACTATA CAAGTCAGAT GTTTGGACAC ACCTACTCAG 1020
GGCTTTACGC TTTAGAGTTA TGGTGAAGTC AGCAGGACTG TGGGGGAAAA CATATGGAGC 1080
TGGACTACAA TACAAACAAA TAAAAAGTCA ATTTTTGTTA AGGATCAAAG TAATCTTTGC 1140
ATTCCATGAA AGATTCTTTA TAGTAAACAA AGTTCTTTTA CAATGTTAGA ATGTCTTTTA 1200
GAATGTTAAA ATGTTTAGAA TGTCTTTTA 1229