EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01775 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53122773-53124146 
TF binding sites/motifs
Number: 13             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
DUX4MA0468.1chr1:53122948-53122959TGATTAAATTA-6.62
DUXAMA0884.1chr1:53122947-53122960TTGATTAAATTAA-7.34
FOXC2MA0846.1chr1:53122957-53122969TAAATAAACAAA+6.18
FOXD2MA0847.2chr1:53122955-53122968ATTAAATAAACAA+6.06
FOXE1MA1487.1chr1:53122954-53122969AATTAAATAAACAAA+6.29
HNF1AMA0046.2chr1:53122814-53122829GATTAATAATTAATT+6
Lhx3MA0135.1chr1:53122820-53122833TAATTAATTATAC+6.12
Lhx3MA0135.1chr1:53122817-53122830TAATAATTAATTA-6.18
POU4F1MA0790.1chr1:53122815-53122829ATTAATAATTAATT+6.36
POU4F2MA0683.1chr1:53122815-53122831ATTAATAATTAATTAT+6.01
POU4F3MA0791.1chr1:53122815-53122831ATTAATAATTAATTAT+6.54
Sox6MA0515.1chr1:53123085-53123095AAAACAATGG-6.02
ZNF384MA1125.1chr1:53123035-53123047TATCAAAAAAAA+6.14
Enhancer Sequence
AAATGGCTTC CTGATTACAG CACACAAATT TTGTTAAAAA AGATTAATAA TTAATTATAC 60
AAGTCAAGTA ATGAATAAAT AAGAAAACAT TGTAATAATA CACGCTTTTC CCCATAAAGC 120
ATTTTTCCCA GTTTCACCAT ACTTAATCTT AATTCTTATA TAAAAACACA ACATTTGATT 180
AAATTAAATA AACAAAACCA CATTCTACGT TTAAGAAACT CATTTGAACA TAATGATTAA 240
TAAAATCAAC GCCTAATTCC GTTATCAAAA AAAACGAGAT GTACGACAGC AGCCACCAAA 300
CCAATGTCAA CAAAAACAAT GGCGGACACG GTTGGACATC ACACACACAC GCACGCGCGC 360
GCGCGCACAC ACACACAGTG ATGTGACAGC AATTAACATG ACGAGTCACA ATAAACACAA 420
TGAAGCAGTG GCTTTTGTGT CATTTTGAGC TTCAGTTATA TAATCTATCG CCATCATAAT 480
AAACAGGCAC ACACACATAC ACACAGCAGA ACTGACAGCT CATCATGAAC ATGAACAAAC 540
GTGCCTATAA CACACACACA CACACACATA CAGTCACACA CCAACACACG AGTGTCTGTG 600
CGAAACACGG TTGTCTGATA ACAATACAAA CACACACATG CATTTATGCT GGAGGAGGAT 660
GTGAAACGTG CGCGCTCTTG TTTTCTGTTT GGCCGAAATG CGTAAAATGG TGGACGCGCA 720
TCAATAATAA CAGCACCACG CATCTCAGCG TGTGGTTTGG ATGCGTTTAA AACGCAATGT 780
TGCGCTGATT GAGATCAAAA TAGATTTGGA GAGATAAATA AATAAGGGTG TCTTGCGTCC 840
GAGCAGCATC CCGGACAAGG CCGAGCATCC GCGCCGGAGC ATCACTGGCC GCCGCGACCA 900
GTGATGCTCC GGCGCGGATG CTCGGCCTTG CCCGGGATGC TGCTCGATGA TGGAGGAAAA 960
AATAAACAAC AACAGTACCT GGCAGACGCT CCGCCAGACG GTGGGATCGG TTCCGCGCCA 1020
GCCCGGTGTG AGACAAACCC AAACCCGCAC GCAGATAATG CTGCTGCTGC CGCCGCCGGT 1080
CGGTCGGTCA TGAGGAAAAC GGAGGCACGC GCGCCCGTGA TGTGGCCATC ATCATCTTCG 1140
TTACCCCGGT GAACCGAATG ACCCTGGATG AATGGCGTAA CCCGATGCAG AAAGCGCGGT 1200
GACGGCGCAC CCCGTCTCCA GCACTCGAAT TTACCCGTAT CCTACTACGC CGAGGGCCCT 1260
GCTGCTTAAT TTTTAATGAG ATGAGCGTCG GGATTGGACT GTAGGGCGGG CAACGTCAGA 1320
TTTGAGCTCA TTAATATGCA GAACGTAAGC CTTCCGCATT GGAGGATTAA CGG 1373