EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01772 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53051729-53053005 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:53052935-53052946ATATTAATTAC+6.02
FOXB1MA0845.1chr1:53052819-53052830ATATTTACATA-6.62
FOXC1MA0032.2chr1:53052819-53052830ATATTTACATA-6.62
Sox11MA0869.1chr1:53051997-53052012CACAATTTCGGTGTT+6
Enhancer Sequence
AACAATGCTA ACGTGCTTTA GGGTCGCCAA CTATGTTTAG GTGTCCTGGA AAACGTGCGC 60
AGCGTCCAAA CGAGATCAAG ACTTCGGGTA TAACGTTATA TATAAAAATA GTCTGTTTGA 120
TTTATCTCAT TTTACACAAT AGCATGTGTA AACTATACTC AAAAGGCGGT TTGAGCATCT 180
AGCAACTTCA CCTTAAATGC TAACTAGCTG GCTACCTCAC TGTATAACCA TACATACTAC 240
AAAGCAAAGC AAACGATACC ACAAAAAACA CAATTTCGGT GTTATTTATA ATTATTGCCT 300
TCAGTAATTG AGTCCGGGTC CTCTTTCAGG CAGCAGCTCG TGTTAGTTCA TCTCTCTGTC 360
TGTATAACGG CTCACAGCCC GCCTTAAATT TCTCACTCCG CTTTATAACA TCAGCATCAA 420
ACCAATCGTC AGTTTATTCG TTAGTCTCGT GTAGAAAAAC CGTTGTTTTG TAAGCAGATA 480
TTTGCGAGAG ACTGTGACCC AGCTCCTCGC CAGTCTCATG CATCACACGC AAGACCGGTT 540
GAAACCGGTT CAGACTGGCA TATTCCATCT CGGTTTAGTT TTCAGCCCGT AGCGCCGCGT 600
AAAATTCGGA CTGCAGAAAC GCCCTCTTCA GCAGCTGATT GGTCGGAGGG GGCAGCGCGG 660
ATTGCTATTT CGCGTGTGAT TGGCTTACAG CGCTGTATGT CAGGGTAAAC CCCACCCAGC 720
GCGTCTTTTT GCCCTTGGTC TCATGTGCAA GGCGGGTTTT GCATCACAGC GTGAGCGTGA 780
GGTGGGCTGG ACCGCGTGGA GCATGGAAAA TTACTGAGAT GTTGCCTGCG ATGTACAAAC 840
AGTAACTGAC CATGATGTGT ATTTTTAGGC CGTGGCTCAT GTTTAAAATG TTTTATATGT 900
GCGTGTTTAT ATTTAAGAAG TAAATAGAGA ACGAATGAAT ATGCTGTAAA GTTTATTTTC 960
ACGTATTAAG TTTTATTTTC ACACATTTGC ATTCCCACAC ATGCAAACAC AGTCTTTTGA 1020
TTGGTAATAC ACATCATAAA ACAGTTTTTT GGCTCTTTTT AAAAGATATC TGATGAGTTG 1080
ATAGACATTT ATATTTACAT ATATGATATG TTCATCATTA CTGTGTATGA AGTGAACAAG 1140
CTGCAAACAC GTCGAGGTCA TATTCTGCCT CAAACAAAAC GAGAAATAAG TAATAACATT 1200
TAGACTATAT TAATTACATT TATACACTAT TTTAAAAAGA TTTGCTGCAT TGCAGGATGA 1260
TACAGAACAT TTCCAA 1276