EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01771 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:53020389-53022211 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Foxd3MA0041.1chr1:53021226-53021238AAACAAACAAAC-6.32
Hmx1MA0896.1chr1:53021999-53022016TCAAGCAATTAATACTT+6.5
Hmx2MA0897.1chr1:53021999-53022016TCAAGCAATTAATACTT+6.38
Hmx3MA0898.1chr1:53021999-53022016TCAAGCAATTAATACTT+6.39
Enhancer Sequence
ATCATATATA CAGAAACACC TTCTGACTGC CATAGTAACT TAAAAACATG ACTATTGATA 60
TGAATCAGGA GTTCTTTCAA ATATCACACA CAATAAAAAA TAGCATGCTT GGAAACACTG 120
TTATTCCCAT CACAGTCTTT ACAAAGCAAA CACATCACTG AGTCCTAAAG TGAAGAAAGC 180
GCATTGATCC ACAACACACA CTCTCTCCTC TTTCCATCCA ACAAAGCAGA GCAACAACAC 240
AAATACTGCT CCCAGTCCAG CAGCCATCAC AGGGCCAAAC ACCGCTAAAA ACTCGCATCA 300
CGACCGCCAG ATCGCTGTAA CCTCCACAAA TCACTCGCCC ATGCAGAATT ACAGTGCATT 360
ACGGACAGTG CTGGGCGATC AGATGCCGAT ATGCGTGCAT TTTGAAGGAT GACAATGTCA 420
AAAACAATCC AGCTCCGGCT AATGCTAATG CTAACGTCAG TTCAACTTCC CGTGGGCATC 480
CACACGTTTG AAAACAAACC GATATTTAGG CCACACATAA ATAAGTGTTT CGAGGATGTT 540
GTTGGAAAAT GTGCAGCAAT GTTTTCTTGG TGATTTTAGC AAGCGAGTTA ACATCTTGCG 600
ATGCTAACGA CTAGCATCGC CTTCGCGAAA ACACACATCG AAATCGAAGA AAGCACTAAT 660
AATGACAGCC AAGAGGAGCT CGAGTGGTGT TTTAAATACA CACGTTGAGG AAAAGTGTGT 720
AACGTTAAAT GTTGGACACG GAAAATTGTG CTCTTGTTGA AGCAGAGAGC CGCATGCTCG 780
GACAGTCATG CTAACAACTT GCAGCAAACA ACTACAAACA GGGACACAAG AGGAAAAAAA 840
CAAACAAACA AATGCTGTTG ACTTACTCTC ATTGAGCACC TCCAGCAGCT CGGCGCAGTT 900
CTCACACATG GTTCATAAAG GCGGAAAGTG TATTCAGACC ATTGGAGAAA TACAAATGTT 960
GCCTGTTTTT CTCTGTCTGT TTAAGGGGGG TTTTAAGGCC CGACGAAATG CTTGATGAAG 1020
GCTCGTTATT GTGACACAAC ACAACCGGGG ACGTTTGGGC TCATGCAAGC GGGGTTATTT 1080
GCCGAGATGT CGAGGGTGGA GACAGTAAAT GTGAGGCACT AAAGGAGCGG AGAGTCAGTC 1140
TCCGAGCAGA GCGTTACTGT GCAGACTAGC ACATACGGTA GCCATGATGA ACAGGGACGG 1200
GAGTTACGCT TCGGTCGTTT CCGTCAGGCG ACTTCAGAGA GGGTCGTGCT TTTCCGGGGA 1260
TGTTCGCAGA TGCTCGGAAG CGAGCAGATA GCGTTGTGTG AGAGTTCGGG TGTTTTCGTC 1320
AAGTCGATGT GTTGGTCGTT CGGGTTTTTC CGGAGGGCGA GGGAGGAGCG ATGGTTTGTT 1380
ACACATCGGC TGTTTCCTAT CGGCCTTTCT TCGGAAATCT CGCGATATCT AGCAGTCGAG 1440
CACGTGTACG TATGATGTTT CAATTTTGAT GAATGCCGTT TGTCATAACT TGCATTTGAC 1500
GTGGCAATAA TGCGTTGCAT AAATATGCGG AGTAGATTAT TATTTTCAAC AATTATTTAT 1560
TTTAAACATA AAATACACAC ATGGTGTCAG GGGGGTCTTT ACATGACCAT TCAAGCAATT 1620
AATACTTTTA ATACAGAACT GCCTTAATCC TTCATGGTAT AGATTAAACA AGACACTGGA 1680
AAAATTTTGC TCCATATTGA CATGACAGCA TCACAGTTTG TCAGCTGCAC ATCCATGATG 1740
TGAATCTCCC GTTCCACCAC ATCCCAAATG TGCTCTATTG GATTGAGATC TGGTGACTGT 1800
GGAGGCCATT TGAGTACCGT GA 1822