EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01724 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:51777512-51778398 
TF binding sites/motifs
Number: 9             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXF2MA0030.1chr1:51777513-51777527CCATGGTAAACAAT+6.23
Hmx2MA0897.1chr1:51777729-51777746ATTTTTTAATTGTTTAT-7.04
Hmx3MA0898.1chr1:51777729-51777746ATTTTTTAATTGTTTAT-7.01
RFX2MA0600.2chr1:51778185-51778201GGTTACCATGGCAGCG-6.03
RFX2MA0600.2chr1:51778185-51778201GGTTACCATGGCAGCG+6.07
RFX3MA0798.1chr1:51778185-51778201GGTTACCATGGCAGCG+6.32
RFX3MA0798.1chr1:51778185-51778201GGTTACCATGGCAGCG-6.32
RFX5MA0510.2chr1:51778185-51778201GGTTACCATGGCAGCG+6.38
RFX5MA0510.2chr1:51778185-51778201GGTTACCATGGCAGCG-6.63
Enhancer Sequence
ACCATGGTAA ACAATATGGG GAGTGTGTCA CTGCACAAAT TACCTCTATT ATAAACACAA 60
CCAATCTCAT ACATTTTTTA ATGGGAAAGC TAAGCTGCTC CTACCTGATT TGGTGCTGTC 120
ATCTGTAGCT GCCTCTAGTG CCATCACGTG TTTGGATTAA TAAACAACTC TGAATTACTA 180
AACTTTAGTT AGGAGCACAT TCCTGTAGTG TACCTTTATT TTTTAATTGT TTATAATACA 240
TTTTGTGCAT TGTTTTGCGT CAGATAACGG AAGAGCTCAG CGAATTAACG GACCCTTTTT 300
GAAAACATTT CCTGTCTGTC ATTGGTCGGT CACAACTGAC AGTCTCGCCC AAGCTCTTAT 360
CATTGGTTGA TGGTCAAAAG GCTTTAGTGT TACATTACTT TTATTTTATT TTTGTAATTT 420
TTGCTGATAT AATTATTTAT ATACGTTGTA TAATACATGT GTTTACCATT CAGGGCTAAT 480
TTATATAATC TACATAATTA TAGTGATTTT TAAAATTATT TTGATACAGT TAAACCGCAA 540
GAAATTAAGT TAAAAACGCT ATTTGATCGA CGTCTGCTGC AATTTTGAAT GCAGTATGAA 600
CTGACCTGAA ATCTGCATGC AGTATATGAT ACCAACAGTT TTGTTGTTAC CATCTGGTTA 660
CCGTCAGAGC TCTGGTTACC ATGGCAGCGC GGTGGAAGTT GTTGAACTAG ATATCATCAT 720
GTCATGCGTT AAGCACGCGT TTACTGCAGT GCAGTACATC AAATTTGCAA TGGAAACCTG 780
TTACACAAAA ACTGAAACTT CCTTAACAAA AGCCTGCTTT AAACTCATTT AAATTGAAGA 840
CAATGTAGAT TCAACATGAA AAATGGATGC TGCTGATCAT ATGAAC 886