EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01692 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:50884005-50885697 
TF binding sites/motifs
Number: 8             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
IRF1MA0050.2chr1:50885351-50885372CTCTCCTTTCACTTTCCTGTT+6.74
IRF2MA0051.1chr1:50885350-50885368TCTCTCCTTTCACTTTCC-6.51
Lhx3MA0135.1chr1:50884845-50884858AAATTAATTATTC+7.34
POU4F1MA0790.1chr1:50884846-50884860AATTAATTATTCAC-6.98
POU4F2MA0683.1chr1:50884844-50884860CAAATTAATTATTCAC-7.05
POU4F3MA0791.1chr1:50884844-50884860CAAATTAATTATTCAC-6.95
RFX3MA0798.1chr1:50884489-50884505CGTTTCCTTGGTAACA-6.08
RFX5MA0510.2chr1:50884489-50884505CGTTTCCTTGGTAACA+6.12
Enhancer Sequence
ATGAAAAAAT AGATACTACT GTGTTTTTTC AAAAACAGCT AGATGTTAAA ATTGCTTGTC 60
ATAATACACT CACTTTTAAC CAGTTCTAAT GTTAACGTCA AGCACGATGT ATTAGGCTCC 120
TTACCACAGA AATATTAGTC TGCTGTAGTG AACAGTATGT GCAGTGCAGT GTAATCTAAC 180
AGGGTAAAGT AGGCGGTGTT TATCGCCTCC TGTTGGACAT GAGAGGTACT TTATCTCCTG 240
TGCACGTCCC GTCCGCGATA GGGTTGCTAA GTCTGCGGTT TTCACGCGTA ATTTGACTAC 300
TTTTAACCAC TTGCCGCATG TTTTTTTATT CCGCGAGGTA AAGCTTGACA TTTTGCATTA 360
CATATGTATA TGATGAAATA TTCTGCTCTA CCAATGATAC AAACTAATAA GCGTAAAAAG 420
AGTAAGAACA CCTTTGTGTT TGTGAGGTCT TTCTTTGAGG AGGAAATGTT TGTGAAGCTG 480
TTTTCGTTTC CTTGGTAACA GCCATATAAA ACCATGGAAA CGACAACAGA CGCACACACT 540
CCAAGATTAA TGCTAATAAT AAATAAAATC AAATGTTGGT ATATGTCATC TGCAGAAGAT 600
TTTAAAACTT CTTTAACTTA AGAAGTCCAC TGTATTCACT TCAGTCGCCG GAGTGTTCTG 660
CATTTGCCAG CATCCATTAC GTTTTAATTG AGTGTTTGGC AAATGTAAGT CACATGAGAG 720
CACAATGCTA GCTGGGCTAT CAGTCCCATG TTGCTGAGAC TTTTATTTAT AGAAACAAAT 780
GGTCAGACTT TCATTGAAGA TTACCAAAAC AGTGGATTTT GTGAGTGGAT AAACTTCCAC 840
AAATTAATTA TTCACTTAAA GAATAACAAT GTGAGCTCGC AAAATAACCA TTAAACTTAC 900
ATTTCAAGCG GACTTTAAGG TAGGATGACT TTTTTATAAA CATATTAAAG TTGCTAAATT 960
CGCACATTTC ACATAACTAT ATGCATTATA CATGATTTCT CCTGTCAAAA TCACTGTATG 1020
ATGCAAACAG TTATGTGAAA TGTGCCAGTT TTGGTATTAT TGTACTGGTT TTAATTGGCC 1080
AACGCGCTAA TTTTGTCGAA TACCTGGCAA CCCTGGATCC GCCTCCCCTG GTTAACACTT 1140
CATCAGCTGC TGCGGTGAAG TCTAGTTCAG TCTAAACAAA CTTAAACGTC CATTCTCACC 1200
AGATAATCAA CTATTTATTA GATTTTTTAT GAATATATCT CTATATAAAA GAAATAGCGA 1260
GGGAAAGCGC CTCGCGAAGA AAGCATTGGG CTGAGGATGG TCAGTCAGTG TGATGAATTA 1320
AAGCGTCTGT GTCCGATTCT AATGCTCTCT CCTTTCACTT TCCTGTTTAA ACTCACGACC 1380
AAAACAATCA TCTCAGCAGA GGAGAATCTT GAAGCGGATC CAAAACCCTG TTTACAGTTC 1440
TGGCAAACTG TTTTACGCTG ACATATTTGA CTCTGAAGCA GCTTTCCTGT TTGCATTACG 1500
AGTGTATGTT TCAGATCAGT TATTTGGGAA GGTTATAAAG TTCCTGCAGA ACTTCAGCTG 1560
TGCCGAGGTG AGCTTTAGCA CGGAAATGAA GGATACAGTA TATTTTGGGG GCATAAAGAA 1620
TTTTAGCATT AGCTACGTGT AAACGTATTT TAAACTATTC CTCTGTAATA TGCTGTGTTT 1680
TAACAGTATT TT 1692