EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01670 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:50348251-50349784 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
NFYAMA0060.3chr1:50348938-50348949TCTGATTGGTC-6.14
NKX2-5MA0063.2chr1:50349361-50349371CTCAAGTGGT-6.02
PROP1MA0715.1chr1:50348578-50348589TAATTTGATTA-6.02
Enhancer Sequence
AATGATAGTA TTCAATATTA AGTGAATTTT ACAAACTTCG AAAGGATAAT GTGAAATGAT 60
TGACCGCGGC TGGTCTCCCA TTTTTAATCA TTAGTAAACC GATCGGATTA ATCCAAACTC 120
AAAATAATAA TCCTGTCTAG CATTACTCCC TTATCTTCGT TTTTTTTTAA GAATCTCCAC 180
TTTCACCCCA TCTTCCCTTT TCCACCTTTA CTAGGGGAGC TCTTGAGAAC GACCTTATCT 240
CCCCCCCAGT TTGTACTTGT ATTTGTCATA TTTTTGGGCG AATTTTGTAA ACTTTTACAA 300
ACTAAGGCCA TGCACTTTAT AATTAAATAA TTTGATTAAT TAGAATAAAA AATGTTTGGG 360
TTTATTTAGT GATTATACGA ATAAAACAAA CAGAAAAAAC GTGAATTTGT CAGTTATGAT 420
TTGTATTTAT CCTATTTTTT GTCAAATTAA GGTTTCATAA AATGTAATTC CCGGAAAAAC 480
ATCTTATCTA TAAACTTTTA CACAGTAAGA CCATACACTA GTACACTTTA GAATTAAATA 540
ACTTCATTAA TTCGAAATAA ATGTACATAT TTATGTAGTA ATTACCACTA TAACCAACAG 600
ATGACGCTGT TTACGCTTTT AAACGCTGTC AACGACCGAA ACTCAACTGA ATGCTTTATG 660
ATTGGTCCGT CCAGATCTTC CTCCACCTCT GATTGGTCCG TGAGCAAACA TCAAACCCAC 720
ACACCACATT CTTGCGACAC TTCCGCCGTG CGGCCGCGTT GTACAGTCAG TGAACGTAAG 780
TATCCTGGCA TGGCTTGTCA GAAAAATGAG CAAGCAAGTT TGTCTGCTGT CTAGTTGTGC 840
TTGAGTGCTA TTATAGTTCC CCAAACCCCG CAAAAACCCT GATCTCTGAA CAGCGCGCTT 900
GTGTTTGCTT CCAAGGGGCC ATTGCCCTAT TCATATATGG CAAAGTTCAT GACAGCTTTA 960
ATCCTATAAA TGGATTGGAG GTTTTCTGTG ACTTTTGTTG TGTTTGGACA AACAGGAGCA 1020
GGTTGTTTGG CCTTTTCTGC TCATTTGTAG AGCCAATAGG TAGCTTGACA TTTAAAGGGG 1080
CCGTTCAGAC AAACAGAACA ACCGTTAAAA CTCAAGTGGT GCCTCTCTTA AAACTGGCTA 1140
ATGCTTGGGC TCAAGTGGCT TGCTTGCTTT CTAAAATAAA TGCAATAATA GCTGATACCT 1200
TTTGAAATAA TACCCAACAT TTTATTTATC AATAATAACG ACAACAGAAT GTTATACACT 1260
GAACTGTAAT TTATGGTCGC GTTATTGAAT GGGGTCACCC TTAAAGGGGG CAGTTCACCC 1320
AAACATTTAC TCAACATCTA CTTGTTTTAT TCCTTTTTTA CTCAAATGAA GAATTTTGAG 1380
CTTACAGTAT TACAGTATTA TTGGAAATAC TGTATCTGGA ACATCAGCTG TATCTGTCAT 1440
CAGCACGGAT AAACCATGCC AAAGTGGACA TTCTTACGGC ATGGAAAATC TGTATATGCA 1500
ACGTCAAAGA AATCTTGGAC ATTTAACCCT CAT 1533