EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01661 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:50250442-50251590 
TF binding sites/motifs
Number: 4             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXE1MA1487.1chr1:50251053-50251068TGTGTTTGTTTAGTG-6.05
Foxj3MA0851.1chr1:50250839-50250856ATCAGATAAACAAACAC+6.12
Foxq1MA0040.1chr1:50251513-50251524TATTGTTTATT+6.62
KLF9MA1107.1chr1:50251321-50251334TGTGGGTGTGGGT-6.32
Enhancer Sequence
TTTTCAGATA CTGATTTAAT AGCTATATAT TTTACAGCTT GATAATGACT AGCCTTATAG 60
ATTGACAAAT TAGCCTACAA GTTCTTAAAT CAAAAACGCA CAACTACATG AGTAATGAAT 120
TCTAAATCTT TGGCACTTAC TTGAACGGAA CTAAACTGAA CAACCTTACA ATGTGAGAGA 180
TAAATTTCAC AGACATTTTC AAGTACCTGT TGAGAGTGTG TTGACAATCA GTGCAGTGAC 240
AGATTCAATC AGTGCAGATT TTAAAAAAGG CGGGAAAAAG AAACCAAGAC TCTTCCTCAA 300
AACAAGAGAG TTCTTAAAAC GAACTGCTTC TATGAGTAAA GAATGATCTT TTTTAAAAGG 360
CTTTTCCTCA GTCCCCAGTT CTCCCTCCTG CCTCAGTATC AGATAAACAA ACACTCAGGA 420
TATCCTGAAG AAACCGTAGT CTTAGCCAAA GGCTGTGTCC TAAATGGAGC GTCATTAACT 480
CCACTGAGCC CTCCACGTTA GATATGCAGC TAATTAGAGG CCCATTCAGA TGTGAACCAC 540
CGCAGACGCT CTTACCTGAC AGACCGCTCT GCTCTTCAAA CTTCAGCGCT CTTGTTTTCT 600
TTAGTGCCTG TTGTGTTTGT TTAGTGTTTA GAGGGACGTC CGCTGAGATG GGGCTGCTGA 660
TTGACGTGTG AATGTCCTGA TGGGGCTGAC AAAATGGGTG TCTTTTTTAT AATCAAATTG 720
GACTTGAAAT TACAGTAGTC CCAGAGAGAT GTTTTTAATC GCTACGTCCA GATAGGATTT 780
GGCGGAGCAG CTCTCTGGAG AGTCACTGCA CCCCAGAGTC AACTTTAGTT AATGGTGTTA 840
GCATAAGATG ACTTAGTGTG AGATTAATTC ATTAAGTAGT GTGGGTGTGG GTAGTAATGT 900
GACACTGCAC CGATTTGCTC CAACACTAAT TGTTGAGGCG GTTTAAAGTG ATCTATAGGG 960
AGCCTTCTGT TTTGTTAGTA TTGTATGTGT GCTGCACTTA ATTATTTCAA TTTCTCTGCG 1020
ATCCCTTTAA AGAGTCTTTT AGTTCTCAAG AAGGCTTTGG GACAACTGGT CTATTGTTTA 1080
TTATAGGTTT GTGTTGGAAA GAAGTTAACG TGTCCATTTA TTAATAATTT TCCTTATTTT 1140
ATTGAGCC 1148