EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01613 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:49006238-49007170 
TF binding sites/motifs
Number: 18             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:49007141-49007157GATTGTTTACTTAAGG-8.4
FOXC2MA0846.1chr1:49007142-49007154ATTGTTTACTTA-6.92
FOXD2MA0847.2chr1:49007143-49007156TTGTTTACTTAAG-7.34
FOXE1MA1487.1chr1:49007142-49007157ATTGTTTACTTAAGG-7.2
FOXF2MA0030.1chr1:49006408-49006422TTTGTTTACCTTGC-6.45
Foxj3MA0851.1chr1:49006405-49006422TTATTTGTTTACCTTGC-6.05
Lhx3MA0135.1chr1:49006988-49007001ATTTAATTAATTT-6.07
NFYAMA0060.3chr1:49006522-49006533TCTGATTGGTT-6.62
RFX1MA0509.2chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC+7.15
RFX1MA0509.2chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC-7.16
RFX2MA0600.2chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC+7.07
RFX2MA0600.2chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC-7
RFX3MA0798.1chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC-6.38
RFX3MA0798.1chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC+7.14
RFX4MA0799.1chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC-6.55
RFX4MA0799.1chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC+7.16
RFX5MA0510.2chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC-6.62
RFX5MA0510.2chr1:49006952-49006968AGTTGCCATGACAACC+6.9
Enhancer Sequence
ATAACGTTAA TACACTTAGG TTTATACTTT TGGACACATT CTGATTTACG GAATACTAAT 60
TGTGTATGGT TTTGAATACC AGCTATAAGT TTTTGATTGC TTGAAAGCCA CTTTATTTTA 120
ATCCGTTTTT ATTTTTATTC TGTTTTTATT AATAATTCTA CATTTATTTA TTTGTTTACC 180
TTGCTTCACC TCACTGCTCC ATCTAAACGT TAAACTTTAA ATGACTGAAT GTGACTACAA 240
CTTGTAGTCA AGGCAACGGA CGCAAACGGA GGCAGATACC GGTTTCTGAT TGGTTGTCGT 300
TACTCTGATC CTTTGACTGA CAGTTTCATC CTGTCTTGTG ATTGGTCAGC GTGGATGTTT 360
ATCCCTCAGG GTAAAGAGCT TGTTGAGATT TACTTTAACA CGCTTGCTTT CGTTTACCAG 420
ACCCACTAGA AGAGGTAACA GCATCGAATT TACACAAAAA TACTTTGTTT TCTGCGTTGT 480
ATAATTCATT TGCAGCTTTT ATCTCACAGG CTTATGTTAA ATGTAACTTT TTTCGTGTTA 540
ATGACTTTTC GAGCTTAGTA TTGCATTGAA GCAAGCCACA TTTAGGGCAG GCTGTGCCTT 600
GTAACTGACG TTATTATCAA TATTCTCTAA AATAGCAAAA TACTTCATAA GTTTGACCTC 660
ATATTCTTGT TAATAACTGA TTTTTATTGT TATATCGTGC AACCGTAGTA TTTGAGTTGC 720
CATGACAACC TCTGTCGCCT TTTGAAGTTT ATTTAATTAA TTTTGCTTGT ATTGAAAATA 780
TTTTATTGCA AGTTTTCTAG AAACTTATGT TAACATTTTA AATATGCACC AATTTGCCTA 840
ATTTTTTACA CAAAATGTCT GAATATTGGA GAAAGTGATA TAGGTTATTT GACATCAGCA 900
TCAGATTGTT TACTTAAGGT ATTATATTGT AT 932