EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01603 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:48689624-48691636 
TF binding sites/motifs
Number: 14             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
ALX3MA0634.1chr1:48689814-48689824TCTAATTAAA+6.02
ARGFXMA1463.1chr1:48689814-48689824TCTAATTAAA+6.02
BHLHE23MA0817.1chr1:48689651-48689663CAGCATATGTTT-6.04
POU1F1MA0784.1chr1:48689794-48689808GATATGCAAATGAG+6.76
POU2F2MA0507.1chr1:48691017-48691030AAATGCAAATGAG-6.28
POU2F2MA0507.1chr1:48689795-48689808ATATGCAAATGAG-7.52
POU3F1MA0786.1chr1:48689795-48689807ATATGCAAATGA+6.18
POU3F2MA0787.1chr1:48690029-48690041GTATGCAAATTA+6.04
POU3F2MA0787.1chr1:48689795-48689807ATATGCAAATGA+6.37
POU5F1MA1115.1chr1:48689795-48689806ATATGCAAATG+6.32
Pou2f3MA0627.1chr1:48690027-48690043ATGTATGCAAATTACG+6.36
ZNF384MA1125.1chr1:48690238-48690250TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:48690239-48690251TTTTTTTTTTTT-6.22
ZNF384MA1125.1chr1:48690240-48690252TTTTTTTTTTTA-6.37
Enhancer Sequence
CACAGTGGAA CAAACTGCCA ACTTATCCAG CATATGTTTT ACACAGCGGA TGCCCTTTCA 60
GCTGCAACCC ATCTCTGGGA AACATCCATA CACACTCGAA AAAAAAATTC TCATTTAAAA 120
ATTGCTGCCA TTTTTTTTTG CATCACAAGC TTTCTGAAAT GTTATGTTTG GATATGCAAA 180
TGAGGACACG TCTAATTAAA CGTGCTATAA TTTGCATAGT TTGCAGGTTT ATATTTCATA 240
TTGTTGACAT ACACAAAAAA ATAGATTTTC ACAACTATAA TGATAATAAT AATCAAAATT 300
TCACACCAGC GATTTCTGAG TGAAATTAGT TTCTACACCT TTTTTTAGTG TGTGTCAACA 360
AAATGAAATG TTTACCCTGA CCTTATACAA AGTTCAAATG TAGATGTATG CAAATTACGG 420
CATGCTTAAC TAAACAATGC CTTGTTTGCA TATCCAATCA TAACATTTCA GGACACTTGT 480
GATGCAAACA TGTTTGTAAT TCTTGCCAGT CTGGAGAGCC AACATTAATA ATTGAAATCT 540
GTGAAAAGTC ACAAGTACAC ATCTTAAGAT GATGTTAAAA GCAACAGGTA TTATCTTTGT 600
TTAACCTGTA TATGTTTTTT TTTTTTTACT TTCAAAGTCT AATTACAGGT AAGTTGCACC 660
ACGGTATCAG CAAAAAAAAA ATTGAGATCC ATAAAAAAAA CGAGTAAATG ATCACAGATA 720
TTTTTGCGTG AACTATCCCT TTAAGAGTGC TATTTGCATG TATTTACTGT TTTCCTTAGT 780
CTTTCCACTT TACTTCTCCT TTTCTCTTAT ATACGCAATG TTTGCTAATA TGTTATAGAA 840
AAACATGCTG TGTTGTAAAT GTATGTCATT ACACAATATG CAGATAAAAC ATTTTAAAGA 900
CACAAAAGAA GTGGCATTTG CTGTTGAGAA AGCAGTGCCC ACAGAGTCGG TCTGCGTTGA 960
GTTGGAGATT ATTAGAGAGT CCTTTGAGTC CCGATTCACC TGCGGAGCGA AGACTAAAGA 1020
GCTCAGTGGG CAAATAGAGA TCACAGCAGC TGCCAGAGCT GTCGGCCAAA ACACCCAGCA 1080
GAGAGGAAGA AAAGAGGATG AGAGGCCTTT CAGTTCAGCG CCACTTAGAA ACAACAGCCT 1140
TGTGGAAAAC GGCAGAGACA AATCCCTCTG CGACTAAATA TCACCACTCT CTTTTGTGTG 1200
CGGTTTATGG ATAATAGTTT GAGATCAAGT TTTTAAATGT GCATTTTTTT TATTTGAAAT 1260
CTGACGTAAT CTAGTCTGAC TCGAGAAGGC GAGGCGGGTC ATATTATAGC CCCTCCCCTT 1320
TATAAAAATC AGCCAATAGC GTTTGATTTT TATCACAGTT CTGATCTCTG GTTGAGATCA 1380
AATGCATCGA ATGAAATGCA AATGAGAAGA GTGGGGCGAG GCATGTCAGA TACTAGAGAG 1440
CATTTGATTG GTCGAGATTT GATAAGAAAC TGAGGTCACA AAAAATCGTT GATCCATTAA 1500
GGCGGAAACT GCAAGCTTTG GGTGTTTATA TCAGTTTATA TCTTATAAAC ATGAATTATC 1560
ACTGTTTTGC AGCACACTAG CTCACTAATA CACACTAATA CTAACATCCA ATACAATTTT 1620
TGCTTTAATT TCATTAGACC TTCAAAATAA GAAGATTTTG CTCACCAAGG CTGCATTTAT 1680
TTGATTTTGG TTGGTTAATT GATTTGATTG GTTAATTAGG ATTATTATTG GTTTCAGGCA 1740
TAGCTTGACA TTAACACCCG CCTACCCTCC AAATGTGGGT AGATTTCAGA TATGGTGGGT 1800
TAGACAGACA CCTGCACTAC CACTTTGGCT GGTTGAAAAT AATTTTTAAA TTGCCAGTGC 1860
TGGCTCATGA CTAAAGATCT GAATTTTAGT TAAAGACTGT TTGTGAATAT GCGTGCAAAT 1920
GTGCTCTTAG AATCGAAAAG CAGCACGATT GATAACAGTT CGCACGAGCA AAAGAAAGCA 1980
GGTGAATAAC GAATGAGAGG ACGATCAGGC AC 2012