EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01602 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:48686904-48688804 
TF binding sites/motifs
Number: 19             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXD2MA0847.2chr1:48687201-48687214GCTAAATAAACAT+6
FOXK1MA0852.2chr1:48688570-48688584TTCTTGTTTACTTA-6.19
POU1F1MA0784.1chr1:48687711-48687725GATATGCAAATCAG+6.12
POU1F1MA0784.1chr1:48687421-48687435GATATGCAAATGAA+6.22
POU1F1MA0784.1chr1:48687256-48687270CATATGCAAATGAG+6.71
POU1F1MA0784.1chr1:48687185-48687199GATATGCAAATGAG+6.76
POU2F2MA0507.1chr1:48687712-48687725ATATGCAAATCAG-6.5
POU2F2MA0507.1chr1:48687186-48687199ATATGCAAATGAG-7.52
POU2F2MA0507.1chr1:48687257-48687270ATATGCAAATGAG-7.52
POU2F2MA0507.1chr1:48687422-48687435ATATGCAAATGAA-7.82
POU3F1MA0786.1chr1:48687186-48687198ATATGCAAATGA+6.18
POU3F1MA0786.1chr1:48687257-48687269ATATGCAAATGA+6.18
POU3F1MA0786.1chr1:48687422-48687434ATATGCAAATGA+6.18
POU3F2MA0787.1chr1:48687186-48687198ATATGCAAATGA+6.37
POU3F2MA0787.1chr1:48687257-48687269ATATGCAAATGA+6.37
POU3F2MA0787.1chr1:48687422-48687434ATATGCAAATGA+6.37
POU5F1MA1115.1chr1:48687186-48687197ATATGCAAATG+6.32
POU5F1MA1115.1chr1:48687257-48687268ATATGCAAATG+6.32
POU5F1MA1115.1chr1:48687422-48687433ATATGCAAATG+6.32
Enhancer Sequence
TTATTTTCAA AAATATTATG TCAAGTTATC ACTTAAATGA GGTGTTTTTC CTTAAAACAA 60
GCAAAATGAT CTGACAATGA AGTAAAAAAA ATCAACTTTC AATTTGAATT TAGCTAATTT 120
TGCTTAGCCC ATATAGGAGG AATATATAGG AAAACTATGG GCAATCCCAA GTGCCGGCTT 180
TTTAAGATTA ATTTGTCCAT ATTTTGTACA CACTACTCAA TTACAGTAAT TTGAGTATTT 240
GTAATTCGTT ACTTAACACC ACTAATAAAA GGTCATGTGT GGATATGCAA ATGAGTTGCT 300
AAATAAACAT GTAGTCATTT GTGTAGTCTT CCAGAAGATG ATTCTTGCAT TCCATATGCA 360
AATGAGGGAT GTTTAAAATG GCCGATTAAA ATTGTAGCAA AATTGTAAGG CGCTGAATTA 420
ACTTATTACG TTTTTGAAGA AGAAATTTTG AAATGTTTTT TTCTTAATTT AGATTTGCTT 480
CATTTTCATT ACAAGTTTTT AAAAAAAATA ATGTTTGGAT ATGCAAATGA AGAACTGTCT 540
CATTAAACAT GCGCTAATCT TTATATTCCT CCAGAAGTGA AATCAGACCG TTTGACGTTT 600
TTTATTCATT CTGTTGAAAT TTCTCCAACA GATATTTGGC GTGAACACAC TTTTCTCCCT 660
GAAATTGCTA ATTTAAGGAT TGTAACACAA ATTTACATTT TGCCATTTTT ATTTTTTATT 720
TTTTTGTTTT TTGTAAAAAA ATCGAATCAC TTTTGCCTAG TTCTTGTTTC AACTGCAAGC 780
ATTTCTGCAT TACAGGTTTT GTGTTTGGAT ATGCAAATCA GGCATTGTCT AACTCAACAT 840
GCACAAATCA TTTGCTTCTC AGAGGCTTCA AAGGGAATCA ATTACACTTA AGTAACCGTA 900
TGAATAGATT CTCTTTCCTT TCTTTGCTTT GCTTTGCTTT GCTTTGAGGA GGACGTCACG 960
CCTCATCCAA ACTTGCTTTT CCAAACAAGT CCGGCGACTG CATGTTGTTT CCCAAATGAA 1020
GGGATAATGA ACTTTTAGGG CAAGACACAC CAGGTGAATA GGGTTAAAAT GTGAAGGAGT 1080
TGATTGATTA CATTCACAAC TTAAAGGAAC ATTCCTGAAA TGTCATGCTT GGATATGCAG 1140
ATGTGTCTGT GCAATTAAAT ATGGACTAAT TTGTAGAATC TTCCACACTG TAAAACCCAA 1200
AAAGTGAAGG TAACTCAAAT GGTTTGAGGA CACCGATTGC AACAAACCAT TTCAATTCAA 1260
AAACTAATCC TAAAGAGGAC TGTGAACTTA ATCCATTTAA GTAAACGAAG CAATTTGAGC 1320
ACAGTAAAAC CCAATAAATG AAGAGAACCA ACTGAGTACT GTAAAACCCA AATAGTTAAG 1380
GCAACTCAAA CCTTTAAAGG AAACCAGCTA TTACAAACCA TTTGAGTTAA ACTAATCTAT 1440
ATGAATATTG TGAACTTACT TGATTTAAGT TGAAGTAATG AGGTATTTAA TAAACTTATT 1500
ACTTTCAATA CTGAGTTCAA AACTTCTTTC AAATGAGTAG ACTTAACTTT CAGTACATTT 1560
TGGGTTAACT ACACTCATTT CATTTGATAA AGTTGACTGC TGGGTTTTAC GGTGCAAAAG 1620
AGAAAAATGT CCATTTAATT TATTTTCTTA GTATTTTTTA ACAAAATTCT TGTTTACTTA 1680
AATTTAGCTG ACATTTCACT GAGGAAGGTT TGGTTTAGAA ACATATTTCA CTCAGAATTT 1740
GGTGGTACAC TATAAAAAAT CCTGGTTGCC TTTAATTTTT AAGTTGAATC AAATCAACCG 1800
AGTCCACTGA ACTTATATTA TGTTAAACTG ACTTATAACA ACTTGCGTAA CTTATACAAT 1860
TAAGTTAGAA CATGATTAAC TTAGTTTAAT AAGTTACAAT 1900