EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01597 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:48652543-48653589 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
HNF1AMA0046.2chr1:48652670-48652685TTTTAATTATTAACA-6.15
HNF1BMA0153.2chr1:48652671-48652684TTTAATTATTAAC-6.24
TCF3MA0522.2chr1:48653042-48653052AGCAGGTGTT-6.02
Enhancer Sequence
AGAGGAAACC CCCATGCAGA TATTAGCCTA TCATAAATGT GCATATAGGT TCCATATATG 60
CGCATATGGG TTTTTTCCAT GTGGGAGGGG TGGGCAAATG TATATTTTTA TAGGCTATTA 120
TCTATTATTT TAATTATTAA CATTATTATT TAAAATACAG ATCAGGGCGA GCTATTTCTC 180
AGTATATAGA CTGACCATAC ATCTCTTTGT CATGTCCTTC AGGGGGGATA AAGCGTTAAT 240
AAGGGGAGTT ATCCCCAACC CCCTCGTAAT TCGCACCCTG TCGTTGTAAT AAACACAATC 300
TCGATCGTTT AAATTGACAA TATAGACAAT TCGCATATGA AACGTCAAGA AAGAAAGAGA 360
ATGAAAGCGC ACGGCATACG CCATTTATCC TGACCGTCTC CAGTGTAATT AATACTTACA 420
TATTTTTCAG TCCCCGTCAA GCAGGTGCCG AAGCTAAGTG TTAAAAAGTA ATTATTGGTG 480
GACTGCATAG TCAGCACACA GCAGGTGTTG CCAGGGCAAG AGACGATCAT TTTACTGAAG 540
GTGTAGCGCT TCTGTCTGCG TGTGTGTGTG TGTGCGTGTC TCAGTAGGAT CTCCTCAATA 600
CTGGCGCCAG CAGAGAATGC CTTTCATTAG TTTCATTACA GACTCTCACT GTACCTCTCT 660
CTCTCACACA CACACACACA TATACACACA CAGACGAATT AAATGAAGTG TCAAAACACT 720
CGAGTGAGAC TGACAGTGAG CCGGTGGACT GTCTGAACTA ATGTTCTGCT GAGGCAATCA 780
GGAAATACAC CAGCGGTCAA AATACAGTCA AGCATTTCGA CTGTTTTCAC TACTTTTAAC 840
GTCAGGTAAA CTATTTAAAA AGTACAAGGG AGACATTGGA ACAACATACA TTTACTACTT 900
AAATTGTGCT GCTTGTTGTT GGAAAGTATG TTATAACTAT ATACCGTTGT TGCTTAAGAT 960
ATCCTTGTGT TGCTTCACGC GGGGAGTAAC GTTAGGCTAA ATATAACGAG CTTAATTTCT 1020
TTGACTTGAT GAAAATACGA CTTTAT 1046