EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01507 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:45760690-45761598 
TF binding sites/motifs
Number: 11             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
EsrraMA0592.2chr1:45761522-45761533TTGACCTTGAA-6.14
Nr5a2MA0505.1chr1:45761521-45761536CTTGACCTTGAATTC-6.29
PBX2MA1113.1chr1:45760815-45760827CCTGTCAATCAA-6.44
PBX3MA1114.1chr1:45760812-45760829GTGCCTGTCAATCAATT-6.29
Rarg(var.2)MA0860.1chr1:45761513-45761530TGTCCTTTCTTGACCTT-7.44
ZNF384MA1125.1chr1:45760756-45760768AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:45760918-45760930AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:45760919-45760931AAAAAAAAAAAA+6.22
ZNF384MA1125.1chr1:45760917-45760929TAAAAAAAAAAA+6.37
ZNF384MA1125.1chr1:45760916-45760928TTAAAAAAAAAA+6.44
ZNF384MA1125.1chr1:45760915-45760927ATTAAAAAAAAA+6.74
Enhancer Sequence
TTTAAATTTA TAAAACATAA AAATCACAGA GAGTTGGAAT AGATGTTTTA ATCCCAGTTT 60
CTTTGCAAAA AAAAAAAAGG TTCTGTGGAC TGGATGTGTA CACATGTTAT TATAGAAACA 120
TGGTGCCTGT CAATCAATTT GGTGGGGCGG GGAAACCACG CTCTTACTTC CCGTTGCATT 180
GGGCCTCAAA ATCACTGGTA TTTGGGTGCT ATTGTAACGT TAAGAATTAA AAAAAAAAAA 240
ACAGACACTC TTTGGGTTTC TAACACTCCA ATATGACAGT GGACACACTA CAACTTTAAT 300
CAGTTCTGTC CAAACAGCAT AAAGTTGATT TTCATCATAG GTGCCCTTTA GACTACGATA 360
TGTAATCGCT TTAATGTCTT TTAGAAGCCT TGAATGTAAT ATGGAGGGGG AAGTATTAAA 420
GCATTAAACA ACAGAACTGT GACAAACCTT CTTGCTGTGC TGGTTCGAGT CTTGGCTTTT 480
TGTTTGCTTT TATGTTTGTC CAATATTGTG TTTGAGCATT GTTGTCTTTT ATGAATTGTT 540
TCTCTTCTTT AAAGTGCTAT TCAGCTTCTG GGAATTTAAA ACAAATGTAA TTTTGTAATT 600
CTGCTTGTCG AACACAAGAT GTCGCCACGT TCCTCAAGCA CAGAGTTCTG AGCTCCTCGA 660
GGTACAGTCT TGATGCAGGT AATGCAGCAC TACTCATCCA TGATTCTATC TACTACATTT 720
GTGTAGTTTC ATCCTTTGAC GATATCAAAT TGTGTTTAAT TTTTATAAAC GTCTGCAAAA 780
TAACGACTGA AAAAATACAG AATTAACCAC GAACAAACCC AAATGTCCTT TCTTGACCTT 840
GAATTCGATG ATGACTGCAG TGTATTAAAT GCCATGCAGT TTTTTTTTTT CAAATTATGA 900
CTGTTTGA 908