EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species
EnhancerAtlas 2.0
TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01473 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:45023111-45025357 
TF binding sites/motifs
Number: 16             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
Arid3bMA0601.1chr1:45023547-45023558ATATTAATTAA+6.62
CDX1MA0878.2chr1:45024044-45024055GTTTTATGACC-6.02
CDX4MA1473.1chr1:45024044-45024055GTTTTATGACC-6.02
Lhx3MA0135.1chr1:45023381-45023394AAATAATTAATTC-6.22
Lhx3MA0135.1chr1:45023548-45023561TATTAATTAATTA-6.25
Lhx3MA0135.1chr1:45023399-45023412GAATTAATTATTC+6.46
PBX2MA1113.1chr1:45023272-45023284GTGATTGACAGG+7.22
PBX3MA1114.1chr1:45023270-45023287AAGTGATTGACAGGTGG+6.14
POU4F1MA0790.1chr1:45023408-45023422ATTCATAATTAATT+6.33
POU4F1MA0790.1chr1:45023400-45023414AATTAATTATTCAT-7.82
POU4F2MA0683.1chr1:45023398-45023414TGAATTAATTATTCAT-6.76
POU4F3MA0791.1chr1:45023408-45023424ATTCATAATTAATTCA+6.33
POU4F3MA0791.1chr1:45023398-45023414TGAATTAATTATTCAT-7.26
POU6F1MA0628.1chr1:45023549-45023559ATTAATTAAT+6.02
POU6F1MA0628.1chr1:45023549-45023559ATTAATTAAT-6.02
mix-aMA0621.1chr1:45023552-45023563AATTAATTAGG+6.32
Enhancer Sequence
ATTAACTTTA ATGTGTGATA GGAATAAAAC ATGATCATAA ACGAATGGTT TCTCCACTCA 60
AATGAATGTC GACTTGGACC CGGAAACAGT ATTACATACG TCAAAAACAC GTCACCACTT 120
AACAAGCGGA TTAACGCCTA TTCACGAGTC CCACGGGAAA AGTGATTGAC AGGTGGTAAT 180
TGTGTGTAAC TTATCTTTAT TTATTTACTG TATGATTTAT GGGTAAAAAA AAAAGACCTT 240
GCAGGTCAGG TAGTTAAAAC GGTAGGCTAC AAATAATTAA TTCGTGATGA ATTAATTATT 300
CATAATTAAT TCACTGTCGC CTATGACGAC GATGCCATCA TCCATCATGA TGTTGTGGTG 360
TTAGACATTG CACAATGCCA AATTGGTCTA CATCGCCCAA CCCTAGTTTA AATCAGGGTT 420
TTCTAGTTAT TTTTAAATAT TAATTAATTA GGATGTATCC ATGGTAGCTA TATTTACCTC 480
TGGCACTCTA GCCTCAATCT AGTTTGGTTT TTGGCCCTTC ATAAGAAAAA GTTTGGGCAC 540
CCCTGCTTAA GAAACCTTGG CCAAGACAAC AGTCACAGAT TGTACCGTTT AACAGGTTTT 600
TAGATGTGTG GTTGGCTCCG GCTTAGCCGT GACCTTACTG TGGGGTGGTC AATTTGGACA 660
AGCAGATGCC CAGCAAGGAA GACGCCCCAA TTTTTCTATA GCGGATTAAT CAAATAAACC 720
AAGATAATCG GTGGCCTTAT GCACCAGTAT ACTGCGTTAT ATCATGGTTC AGAATAAACG 780
AGTTACAGTA ATGTGAATGA AGTTTTGGTG CACTTTTGTA ATGCCTTGCT GAGTTTTTGC 840
CTTCAGGGTA AATTATTTGC TGCTTTATTT CAGTTTTGCA TTTGGAAAGA ATGTTTTAAA 900
ATGACCCTTT ATTATGCTGA AACCACTCTG GTGGTTTTAT GACCCCCCCC CAATCTGCTA 960
AAACACTGGC GCTGACATAA GAGCTTTTAA CTGTCAGCAA ACTAGTGCTA GATATCTTGG 1020
CAGAGAGTTT GTTTGTCTGT GTTTTTTAGA TGGAACTGAT GTCCTGTTTT AATCCTCCTG 1080
GGCTTCATCT CTATCCATCA CCGCGTCCTG CTGCGTGTCC AGTATGCAAA CTACACCCAA 1140
ACCATCACAG CACTATTCAC CATCTGTTCT TTATTTCCTA CTTCCTCTCA AATGTCCGTC 1200
CCTCTCCTTA TCGTCATCTT TGATTCTAAT CTATTTTTGT TTGTGTCTGT TTTGGGCACA 1260
CGCTTGCAGC TTTCACTTTT CTCCATTTAC TACGTTTGCT GTTGATTTCA CTTGTCTCTC 1320
TGATATCTCT CATGTTGTTT TGGCAGCTCT GGTTGTGCCC AGCCCCCGTC AGCATGGTGC 1380
ACAGCACACA ATGGGGAACG TCCTCTCTTA ATCCTTACAT TTACGAATAG CAAATTCAAA 1440
CCCTGCTGGG TCATTAAGCC CCATTCACAC TCTATACTGA CTCAACACAC TCAACTCGCT 1500
CGTCTGGAGC TAATTCTGTT GGACGAGAGG GAGAGCAGGG TCGTCGCGTT TCTTCCTGTT 1560
TATCTGCGTC GTTGCTACTG TTTCACACTA ACAGGGCTGT TTGACATTTC AGCTCGATCC 1620
TACACACAAT AATGGCTCAT TACTGATCCC TACGCGCACT GGTACCATTC ACCATTGCAA 1680
ATTACACTAA CAATAGTGAT CGGTTTCTTT AAGACCGTTC AAACCTGATT TTCAGTTGTT 1740
TCCGCCAGTT TGATCACAAT TGAGCAGTGC TAAATAAAGG GGTAAACAGG GTCTAAAATG 1800
TTTAATGCTT GTTTTCCTTT GAGCCCTTCC AGACGTTTCC TTCAGCTTTC CATCGCGCAT 1860
TGCGCTCCTT TGTCATTGCT CAGTGACCAT CAACCGTTTT CTCAGAGGAT GATAAATTAA 1920
AAAAACATTG CTGCAGTATC AATACAAGTT TTATTCATAT AGAAAATTTA AAAGCACTGC 1980
AGTGTTTGGG TGTCCTGTGT TTGCGGTAAT TAGGCTACCC AAATGTGTAT ATTCTATTCA 2040
AATGAAGCTG ATAGCTCAGT TATTGTTGCA TGACTTGTGG CGCTTGCAGC ATTCTGAAAA 2100
GTAGAGATGT TTTCAACTGG GTGCGCCTGG AATAAGCTTG TGGATCACTC CCAATATGCA 2160
CGCAAGCCAC GCGCCTCCAT TGAAAATAAC GAACTTGTGC ACACAAAAGA AGCGATATGT 2220
CAACGGCAGT GTCACAAAGA GGTCTA 2246