EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01464 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:44899480-44900784 
TF binding sites/motifs
Number: 5             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
FOXA1MA0148.4chr1:44900292-44900308ATTTATTTACTTAACT-6.23
FOXC2MA0846.1chr1:44900293-44900305TTTATTTACTTA-6.07
FOXD2MA0847.2chr1:44900294-44900307TTATTTACTTAAC-6.37
FOXP2MA0593.1chr1:44900021-44900032AAGTAAACAAA+6.62
Foxj3MA0851.1chr1:44900018-44900035AACAAGTAAACAAATAC+6.77
Enhancer Sequence
TTTATTAATT CTAGTAACAC TGTCATATAA TATATTAAAA CTTTGTTGTG GCACATATTT 60
GTTTTCTATT TCATTATCAT ATTACTTTAA ACAAATGTCA TTTAAGGCTT ACAGCTGATA 120
ATTAGCTGGT TAATACTTGA CGAACATGAT GTGATGTGTA GTTTTACCAC TTCATAGTAG 180
CCTAGTAGAT AAACTGAAAC ATTAGGGTAA TCATTCCCAG TCAGACCTTT GTGTAGACTG 240
GAACTAGTCT TGTCTCTAAA CAGGCACACA ACAGAACTTG TAAATTACCA GCAGGTGTGT 300
ATTGAATGAG GGTTGAACCT AACCACTCCT GAAAAAAGTG TCCCATAGCA AGATTAAGAA 360
CATCTGAAAC ACATGTCTGG CTTACCAACT AATAACAAAA GCAATCAACT GATTTTAGTG 420
CAGGTCAGCA ATAGCTTCTA TGCAAAAGTT AAACTTGTAA TCACTTCGTT AAAATTACAC 480
ATAGTTAATT TAATTCACTT TGAATAGTTA AAATTATACT GCCATAGAAG AAAAACCAAA 540
CAAGTAAACA AATACAGGAA GAGAGATGTG ATCTCACACT GCAATCCTCA AATGCAGGCC 600
ACCTTCTGCT TGGAGGAGAA ATTTGCAAGC GTGACTAGCC TTTGTGCGAT TAAAAGCAAA 660
GCACTAAAAC TGAGCAGATG TGGGGGAGGG GCAGGGCTTG GGCTGTACCA TAAATATTTT 720
AGAGGTTACT ATTTAATTTA ATTGCTATCA ATACACTTAT CCGTTGATAA ATAAAAAAAG 780
TGGTACTATG TATATACATA TCTGTGATAC AGATTTATTT ACTTAACTAA AACTCTTTCA 840
GGTTTACCAA TTTTCTTGCT AAACTTCTTT AACCTTTGAG GTAAATTGCT GTAAAAAAAT 900
TAATTTGTTC AAACAACTCA ATTCTTTTAC AATATTAGGT CTTATCAACC TTGCTAGAGC 960
AGTCACACTG CAGTTGTAGC TCCACCCTCT AGCTACTAAG TGACTGAACT GAGCAGACAA 1020
TGGAAAAATA CTGGAGAGAT TGGACCATAC CATTATATGG ACTGAAAGGG GGAGAACTTG 1080
ATTGTTGCAA CTGCCTCAAA TACAGACATC AACTAACATA TTTTCCAGAA AACAAGTAGC 1140
ATCTGTGTAT AAGCCACAAT GGAGCAAAAC TGTGAGGGGA AAAAAAACAA CAACACACAA 1200
ATAAGCTGCA TCAGTGTATA TGTCTAATCT GATTTTGACT ATTTTTAAAA ATATATTTAT 1260
TTTATTATCA AAATAACAAT AATGGAGTTA TGAATTCCAA GCCA 1304