EnhancerAtlas 2.0: an updated resource with typical enhancer annotation in 600 tissue/cell types across nine species

TagContent
EnhancerAtlas ID
DR011-01463 
Organism
Danio rerio 
Tissue/cell
Embryo_epiboly_80 
Coordinate
chr1:44896846-44898222 
TF binding sites/motifs
Number: 3             
TFJASPAR IDCoordinateMotif SequenceStrand-Log10(p-value)
MIXL1MA0662.1chr1:44897130-44897140TCTAATTAAC+6.02
RORA(var.2)MA0072.1chr1:44897638-44897652ATGACCTAGTTTTA-6.27
RORCMA1151.1chr1:44897639-44897651TGACCTAGTTTT-6.02
Enhancer Sequence
CTTATGACTT ACTCAAACTA ACATGTGACT GATTTAGTCA TGTCCAACTC AAAATTAAGA 60
GGAGAATGAC GATATTCGCA AATAACTTTC ATGACATACA TAAGCAAGTT ACTGGTACAG 120
GGATGTCCGT ACTAGTTAAG TTAGTGGTTA CTGGAACAGA TGTACTACCT CCCTGCCTAG 180
TATAATACAC TAGCTAGGTA ATTACAATTT AAATACAATT AAAAATGTAA TACCCTTATT 240
TTGTAATGTA AAACATAAAT ATCCTGACAG TGGACTAAAT AAATTCTAAT TAACATACCA 300
CATTTACACT ATTTTGACAA ATGTGCAGAA ATTTAAATTG AAAAAAAAGA GCTCCCCAAT 360
CCTAAGACAG AAGACACCAA AGCGGATAAG TAATGTGCAG AGGAAGATGC CATTTTGTAA 420
CTTACATGGC AGCACAAACA TTAAGTTAAA CCATTACAAA TATAAAATGC ATTATGTAAT 480
GGAGAGTGGT TAGTGAAATG GGTACAAACA CTCTAAATAA TCCTTAAAAC TAATCATTCA 540
ACAGCATCCT CTGGGAAAAA AAAACGACTT CCCCCTTGTT ATGCTACTGT GCGCACAACC 600
AGCTAATCAC AGACATGACC GGCAGGAACT GGCTGAAACC AGTTTAGACT GGCTTAGCTG 660
TGGGCTGTAC GTCATTGGCA CATGACAGAT AACTCTGACT TTCTAAATTG GGAGGTTTCT 720
ATTAACATTC ACACAAACTA ACTAATGGGG CAAGCTACTA GAAGATGTAA TTTTATAAAA 780
GAATTGATCT AAATGACCTA GTTTTACGCA ATAGTATTGC CTTTGAATCA ACAACAACTT 840
AACTATAACA AGTGTATGAA ATAACAACAC ACATCTAACG GCTGAAATCC TTCTAGACAC 900
AAGTAGCCAA ATGCGGCAGA GCAGCAGTAA ACCCTGCACA CACTCCAGCT AGCACTGAGA 960
GCCAGACTTA CAGCGAGGTC TCTTTAAGAG CTCCTCCCCC GCTCTGCCAT TTTATACAAG 1020
CAGGCACTGC AGTACCACAA AATGGCCACC AGCTTGGCTT CTGGCAATCC AACAAAAATA 1080
AATAAATAAA CACGCAGGTG CACAAATCAT GTAAATTAAA CAGGAAGAAA TGACTAAATT 1140
AAAATAAAGT GGCTCAATTT CATGCTTGTC TGATGTAGTG CCTAGCTTGT GTGCAGCATG 1200
TTTCTTCATG CCTAACTCCT CTGGTTCTTT TGCACCAAGA TACGTTCAGC GATTTGTCCA 1260
CACAGGAGCT GTCGTGCCAT TTAATCAGTG TTGTACAACT ACTACCACAT AAGTGAAAGT 1320
GTGAGTGTGT TCAGGTATTT AAACCTCATT ATCCCAACAA GTGATTCCAT AAAACA 1376